СТРУКТУРА ЗАБОЛЕВАЕМОСТИ РЕСПИРАТОРНЫМИ ВИРУСНЫМИ ИНФЕКЦИЯМИ В Г. НОВОСИБИРСКЕ И НОВОСИБИРСКОЙ ОБЛАСТИ В ЭПИДЕМИЧЕСКИЙ СЕЗОН 2011–2012 ГГ.

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Введение. В структуре общей инфекционной заболеваемости человека ОРИ занимают первое место. Цель исследования изучение видового разнообразие вирусов, вызывающих ОРИ у жителей Новосибирской обл. в период максимальной регистрации случаев заболевания ОРИ (с октября по апрель). Материалы и методы. Исследовано 164 назофарингеальных смыва собранных от жителей г. Новосибирске и Новосибирской обл. с симптомами ОРИ. Выделение вирусной РНК/ДНК, синтез кДНК и ПЦР проводили с использованием наборов «РИБО-преп», «Реверта-L», «АмплиСенс Influenza virus A/B-FL», «АмплиСенс ОРВИ-скрин-FL» (ФБУН «ЦНИИЭ», Россия). Результаты. Этиологический агент заболевания был установлен в 69 (43%) образцах. В 58 (35%) обнаружена моноинфекци. В 14 (9%) образцах были обнаружены коронавирусы I серогруппы (NL63 и 229E), в 13 (8%) – риновирусы, в 7 (4%) – респираторно-синцитиальный вирус, в 6 (4%) – вирус парагриппа типа 1, в 5 (3%) – вирус парагриппа типа 3 (3%). Аденовирусы и бокавирус были идентифицированы в 3 (2%) образцах. Вирус парагриппа типа 2 и 4, метапневмовирус, коронавирусы II серогруппы (HKU1 и OC43) присутствовали в 2 (1%) образцах. В 11 (7%) образцах обнаружена сочетанная инфекция. Выводы. В структуре заболеваемости преобладали коронавирусы I серогруппы, риновирусы и сочетанная инфекция. Пик видового разнообразия вирусов, вызывающих острые респираторные инфекции у человека, приходится на группу детей в возрасте 2–4 лет. В старших возрастных группах наблюдается спад видового разнообразия вирусов и преобладание риновирусной инфекции.

 

Об авторах

Е. И. Сергеева

Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская обл., Российская Федерация

Автор, ответственный за переписку.
Email: esergeeva@vector.nsc.ru
Junior Research Worker, Department Collection of Microorganisms, State Research Center of Virology and Biotechnology (VECTOR) Address: 630559, Novosibirsk region, Novosibirsk district, Koltsovo work settlement, 12; tel.: (923) 239-58-22 Россия

Е. В. Иванова

Центр гигиены и эпидемиологии в Новосибирской области, Новосибирск, Российская Федерация

Email: Virusolog@cn.ru
Head of Virology Laboratory, Centre of Hygiene and Epidemiology in the Novosibirsk Region Address: 630099, Moscow, Frunze St., 84; tel.: (383) 224-26-52 Россия

А. Н. Швалов

Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская обл., Российская Федерация

Email: shvalov@mail.ru
PhD, Research Worker, Department of Molecular Virology of Flavivirus and Viral Hepatitis, State Research Center of Virology and Biotechnology (VECTOR) Address: 630559, Novosibirsk region, Novosibirsk district, Koltsovo work settlement, 12; tel.: (383) 363-47-60 Россия

В. А. Терновой

Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская обл., Российская Федерация

Email: tern@vector.nsc.ru
PhD, Head of the Laboratory of Molecular Epidemiology of especially dangerous infections, State Research Center of Virology and Biotechnology (VECTOR) Address: 630559, Novosibirsk region, Novosibirsk district, Koltsovo work settlement, 12; tel.: (383) 363-48-25 Россия

В. Н. Михеев

Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская обл., Российская Федерация

Email: vn_mikheev@vector.nsc.ru
Deputy Director General for Research and epidemiological work, State Research Center of Virology and Biotechnology (VECTOR) Address: 630559, Novosibirsk region, Novosibirsk district, Koltsovo work settlement, 12; tel.: (383) 336-73-27 Россия

А. П. Агафонов

Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская обл., Российская Федерация

Email: agafonov@vector.nsc.ru
Deputy Director General for Research, State Research Center of Virology and Biotechnology (VECTOR) Address: 630559, Novosibirsk region, Novosibirsk district, Koltsovo work settlement, 12; tel.: (383) 306-15-12 Россия

Л. К. Иванова

Центр гигиены и эпидемиологии в Новосибирской области, Новосибирск, Российская Федерация

Email: cgnso@cn.ru
Head Physician of the Center for Hygiene and Epidemiology in the Novosibirsk region Address: 630099, Moscow, Frunze St., 84; tel.: (383)224-24-52 Россия

А. Н. Сергеев

Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская обл., Российская Федерация

Email: esergeeva@vector.nsc.ru
Director General of State Research Center of Virology and Biotechnology (VECTOR) Address: 630559, Novosibirsk region, Novosibirsk district, Koltsovo work settlement, 12; tel.: (383) 336-60-10 Россия

Список литературы

  1. Svedeniya ob infektsionnykh i parazitarnykh zabolevaniyakh (Forma 1) za yanvar' – dekabr' 2010 [Information on infectious and parasitic diseases (Form 1) for January - December 2010]. Available at: http://75.rospotrebnadzor.ru/content/svedeniya-ob-infektsionnykh-i-parazitarnykh-zabolevaniyakh-forma-1-za-yanvar-dekabr-2010-god. (accessed: 23.01.13).
  2. Svedeniya ob infektsionnykh i parazitarnykh zabolevaniyakh (Forma 1) za yanvar' – dekabr' 2011 [Information on infectious and parasitic diseases (Form 1) for January - December 2011]. Available at: http://75.rospotrebnadzor.ru/content/svedeniya-ob-infektsionnykh-i-parazitarnykh-zabolevaniyakh-forma-1-za-yanvar-dekabr-2011-god. (accessed: 23.01.13).
  3. Van den Hoogen B.G., De Jong J.C., Groen J., Kuiken T., De Groot R., Fouchier R.A., Osterhaus A.D. A newly discovered human pneumovirus isolated from young children with respiratory tract disease. Nat. Med. 2001 Jun; 7 (6): 719–724.
  4. Van der Hoek L., Ihorst G., Sure K., Vabret A., Dijkman R., De Vries M., Forster J., Berkhout B., Uberla K. Burden of disease due to human coronavirus NL63 infections and periodicity of infection. J. Clin. Virol. 2010 Jun; 48 (2): 104–108.
  5. Peiris J., Yuen K., Osterhaus A., Stöhr K. The severe acute respiratory syndrome. N. Engl. J. Med. 2003 Dec;349(25):2431–2441.
  6. Allander T., Tammi M., Eriksson M., Bjerkner A., Tiveljung-Lindell A., Andersson B. Cloning of a human parvovirus by molecular screening of respiratory tract samples. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005 Sep; 102(36): 12891–12896.
  7. Woo P., Lau S., Chu C., Chan K., Tsoi H., Huang Y., Wong B., Poon R., Cai J., Luk W., Poon L., Wong S., Guan Y., Peiris J., Yuen K. Characterization and complete genome sequence of a novel coronavirus, coronavirus HKU1, from patients with pneumonia. J. Virol. 2005 Jan; 79(2): 884–895.
  8. Peiris J., De Jong M., Guan Y. Avian influenza virus (H5N1): a threat to human health. Clin. Microbiol. Rev. 2007 Apr;20(2):243–267.
  9. Fraser C., Donnelly C., Cauchemez S., Hanage W., Van Kerkhove M., Hollingsworth T., Griffin J., Baggaley R., Jenkins H., Lyons E., Jombart T., Hinsley W., Grassly N., Balloux F., Ghani A., Ferguson N., Rambaut A., Pybus O., Lopez-Gatell H., Alpuche-Aranda C., Chapela I., Zavala E., Guevara D., Checchi F., Garcia E., Hugonnet S., Roth C. Pandemic potential of a strain of influenza A (H1N1): early findings. Science. 2009 Jun; 324 (5934): 1557–1561.
  10. Bermingham A., Chand M., Brown C., Aarons E., Tong C., Langrish C., Hoschler K., Brown K., Galiano M., Myers R., Pebody R., Green H., Boddington N., Gopal R., Price N., Newsholme W., Drosten C., Fouchier R., Zambon M. Severe respiratory illness caused by a novel coronavirus, in a patient transferred to the United Kingdom from the Middle East, September 2012. Euro Surveill. 2012; 17 (40). Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23078800
  11. Epidemiologicheskaya situatsiya po grippu v Rossii i mire (2012 g., 53-ya ned) [The epidemiological situation of influenza in Russia and the world (2012, 53rd week)]. Available at: http://www.influenza.spb.ru/en/influenza_surveillance_system_in_russia/epidemic_situation/ (accessed: 12.01.2013).
  12. Andreasen V. Dynamics of annual influenza A epidemics with immuno-selection. J. Math. Biol. 2003 Jun; 46 (6): 504–536.
  13. Atmar R.L., Piedra P.A., Patel S.M., Greenberg S.B., Couch R.B., Glezen W.P. Picornavirus, the most common respiratory virus causing infection among patients of all ages hospitalized with acute respiratory illness. J. Clin. Microbiol. 2012 Feb; 50 (2): 506–508.
  14. Xiang Z., Gonzalez R., Wang Z., Xiao Y., Chen L., Li T., Vernet G., Paranhos-Baccalà G., Jin Q., Wang J. Human rhinoviruses in Chinese adults with acute respiratory tract infection. J. Infect. 2010 Oct;61(4):289–298.
  15. Paranhos-Baccalà G., Komurian-Pradel F., Richard N., Vernet G., Lina B., Floret D. Mixed respiratory virus infections. J. Clin. Virol. 2008 Dec;43(4):407–410.
  16. Allander T., Jartti T., Gupta S., Niesters H., Lehtinen P., Osterback R., Vuorinen T., Waris M., Bjerkner A., Tiveljung-Lindell A., Van den Hoogen B., Hyypiä T., Ruuskanen O. Human bocavirus and acute wheezing in children. Clin. Infect. Dis. 2007 Apr;44(7):904–910.
  17. Naghipour M., Cuevas L., Bakhshinejad T., Dove W., Hart C.. Human bocavirus in Iranian children with acute respiratory infections. J. Med. Virol. 2007 May;79(5):539–543.
  18. Fry A., Lu X., Chittaganpitch M., Peret T., Fischer J., Dowell S., Anderson L., Erdman D., Olsen S.. Human bocavirus: a novel parvovirus epidemiologically associated with pneumonia requiring hospitalization in Thailand. J. Infect. Dis. 2007 Apr; 195 (7): 1038–1045.
  19. Pyrc K., Berkhout B., Van der Hoek L. The novel human coronaviruses NL63 and HKU1. J. Virol. 2007 Apr;81(7):3051–3057.
  20. Lu R., Yu X., Wang W., Duan X., Zhang L., Zhou W., Xu J., Xu L., Hu Q., Lu J., Ruan L., Wang Z., Tan W. Characterization of human coronavirus etiology in Chinese adults with acute upper respiratory tract infection by real-time Rt-PCR assays. PLoS ONE 2012;7(6):e38638.
  21. Ren L., Gonzalez R., Xie Z., Xiong Z., Liu C., Xiang Z., Xiao Y., Li Y., Zhou H., Li J., Yang Q., Zhang J., Chen L., Wang W., Vernet G., Paranhos-Baccalà G., Shen K., Wang J. Human parainfluenza virus type 4 infection in Chinese children with lower respiratory tract infections: a comparison study. J. Clin. Virol. 2011 Jul;51(3):209–212.
  22. Falsey A.R., Walsh E.E. Respiratory syncytial virus infection in adults. Clin. Microbiol. Rev. 2000 Jul;13(3):371–384.
  23. Barati M., Noorbakhsh S., Tabatabaei A., Taj F., Talebi-Taher M. Adenovirus, Influenza Virus A, B and Respiratory Syncitial Virus Infection in Children. International Journal of Infectious Diseases 2008;12, Suppl. 1(0):e66.
  24. Wong S., Pabbaraju K., Pang X., Lee B., Fox J. Detection of a broad range of human adenoviruses in respiratory tract samples using a sensitive multiplex real-time PCR assay. J. Med. Virol. 2008 May;80(5):856–865.
  25. Castro-Rodriguez J., Daszenies C., Garcia M., Meyer R., Gonzales R. Adenovirus pneumonia in infants and factors for developing bronchiolitis obliterans: a 5-year follow-up. Pediatr. Pulmonol. 2006 Oct; 41 (10): 947–953.
  26. Li J., Wang Z., Gonzalez R., Xiao Y., Zhou H., Zhang J., Paranhos-Baccala G., Vernet G., Jin Q., Wang J., Hung T. Prevalence of human metapneumovirus in adults with acute respiratory tract infection in Beijing, China. J. Infect. 2012 Jan; 64 (1): 96–103.
  27. Williams J.V., Harris P.A., Tollefson S.J., Halburnt-Rush L.L., Pingsterhaus J.M., Edwards K.M., Wright P.F., Crowe J. Jr. Human metapneumovirus and lower respiratory tract disease in otherwise healthy infants and children. N. Engl. J. Med. 2004 Jan; 350 (5): 443–450.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Издательство "Педиатръ", 1970



Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах