Preview

Вестник Российской академии медицинских наук

Расширенный поиск

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШИГА-ТОКСИН-ПРОДУЦИРУЮЩИХ ESCHERICHIA COLI, ВЫДЕЛЕННЫХ ПРИ ВСПЫШКЕ ПИЩЕВОЙ ИНФЕКЦИИ В САНКТ-ПЕТЕРБУРГЕ В 2013 ГОДУ

https://doi.org/10.15690/vramn.v70i1.1234

Полный текст:

Аннотация

Пищевые инфекции, вызываемые шига-токсин-продуцирующими штаммами Escherichia coli (STEC), регистрируются во многих странах мира и представляют серьезную проблему для общественного здравоохранения. Сведений об эпидемиологии, этиологической структуре STEC-инфекций и молекулярно-генетических особенностях STEC-патогенов в Российской Федерации крайне недостаточно. Цель исследования: изучить вспышку пищевой инфекции в форме геморрагического колита (ГК) с гемолитико-уремическим синдромом (ГУС), энтероколита и острого гастроэнтерита среди детей в г. Санкт-Петербурге в 2013 г. Методы: в работе использованы эпидемиологические, микробиологические, молекулярно-генетические и биоинформационные методы анализа. Результаты: объектами исследования послужили образцы клинического материала, пробы молока и пищевых продуктов, а также штаммы STEC, выделенные во время вспышки пищевой инфекции. Установлено, что вспышка пищевой инфекции была вызвана потреблением сырого молока, обсемененного STEC, что подтверждено данными эпидемиологического анализа, выявлением в пробах молока ДНК STEC и выделением возбудителей из испражнений больных детей и из проб молока. Данные полногеномного секвенирования показали, что описываемая вспышка была вызвана двумя группами патогенов: E. coli O157:H7 и E. coli О101:H33. Штаммы первой группы отнесены к ранее известному сиквенс-типу — ST24, второй группы — к ранее не описанному ST145, зарегистрированному нами в базе данных shigatox.net. В геномах штаммов обеих групп присутствуют нуклеотидные последовательности VT2-подобных профагов с интегрированными в них генами stx2с и нуклеотидные последовательности плазмид с генами энтерогемолизинов, а также гены синтеза основного фактора адгезии EHEC интимина: в группе E. coli O157:H7 — интимина гамма, а в группе E. coli O101:H33 — интимина йота 2, до настоящей работы обнаруженного только в группе энтеропатогенных эшерихий (EPEC). Заключение: пополнение знаний по эпидемиологии и биологии возбудителей STEC-инфекций позволит усовершенствовать диагностику, лечении и профилактике геморрагического колита.

 

Об авторах

Г. Г. Онищенко
Правительство Российской Федерации, Москв
Россия

доктор медицинских наук, профессор, академик РАН, помощник Председателя Правительства Российской Федерации
Адрес: 103274, Москва, Краснопресненская наб., д. 2, стр. 2, тел.: +7 (495) 985-54-86



И. А. Дятлов
ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Российская Федерация
Россия

доктор медицинских наук, профессор, член-корреспондент РАН, директор ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии
Адрес: 142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, тел.: + 7 (4967) 36-00-03



Э. А. Светоч
ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Российская Федерация
Россия

доктор ветеринарных наук, профессор, заведующий отделом молекулярной микробио-логии ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии
Адрес: 142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, тел.: +7 (4967) 36-00-79



Н. В. Воложанцев
ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Российская Федерация
Россия

кандидат биологических наук, заведующий лабораторией молекулярной диагностики и генно-инженерных препаратов отдела молекулярной микробиологии ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии
Адрес: 142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, тел.: +7 (4967) 36-01-47



В. А. Баннов
ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Российская Федерация
Россия

старший научный сотрудник лаборатории молекулярной диагностики и генно-инже-нерных препаратов отдела молекулярной микробиологии ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии Адрес: 142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, тел.: +7 (4967) 36-00-79



Н. Н. Карцев
ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Российская Федерация
Россия

научный сотрудник лаборатории антимикробных препаратов отдела молекулярной микробиологии ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии
Адрес: 142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, тел.: + 7 (4967) 36-00-79



В. Н. Борзенков
ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Российская Федерация
Россия

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории анти-микробных препаратов отдела молекулярной микробиологии ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии Адрес: 142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, тел.: +7 (4967) 36-00-79



Н. К. Фурсова
ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Российская Федерация
Россия

кандидат биологических наук, заведующая лабораторией антимикробных препаратов отдела молекулярной микробиологии ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии
Адрес: 142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, тел.: +7 (4967) 36-00-79



И. Г. Шемякин
ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Российская Федерация
Россия

доктор биологических наук, профессор, заместитель директора по научной работе ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии
Адрес: 142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, тел.: +7 (4967) 36-00-60



А. Г. Богун
ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Российская Федерация
Россия

кандидат биологических наук, заведующий отделом коллекционных культур ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии
Адрес: 142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, тел.: +7 (4967) 36-00-00



А. А. Кисличкина
ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Российская Федерация
Россия
кандидат биологических наук, старший научный сотрудник отдела коллекционных культур ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии
Адрес: 142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, тел.: +7 (4967) 36-00-00


А. В. Попова
ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Российская Федерация
Россия

кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории молекулярной диагностики и генно-инженерных препаратов отдела молекулярной микробиологии ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии
Адрес: 142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, тел.: +7 (4967) 36-01-47



В. П. Мякинина
ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Российская Федерация
Россия

научный сотрудник лаборатории молекулярной диагностики и генно-инженерных препаратов отдела молекулярной микробиологии ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии
Адрес: 142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, тел.: +7 (4967) 36-01-47



М. Г. Теймуразов
ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Российская Федерация
Россия

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории анти-микробных препаратов отдела молекулярной микробиологии ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии Адрес: 142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, тел.: +7 (4967) 36-00-79



О. В. Полосенко
ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Российская Федерация
Россия
кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории физико-химических и микробиологических методов анализа ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии Адрес: 142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, тел.: +7 (4967) 36-00-20


Л. А. Кафтырева
НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, Санкт-Петербург, Российская Федерация
Россия
доктор медицинских наук, заведующая лабораторией кишечных инфекций НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера Адрес: 197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14, тел.: +7 (812) 313-69-88


М. А. Макарова
НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, Санкт-Петербург, Российская Федерация
Россия
кандидат медицинских наук, научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера Адрес: 197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14, тел.: +7 (812) 313-69-88


З. Н. Матвеева
НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, Санкт-Петербург, Российская Федерация
Россия
кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера Адрес: 197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14, тел.: +7 (812) 313-69-88


Т. А. Гречанинова
Центр гигиены и эпидемиологии в городе Санкт-Петербурге, Российская Федерация
Россия

врач-бактериолог, заместитель главного врача Центра гигиены и эпидемио- логии в городе Санкт-Петербурге по организации лабораторного дела Адрес: 191023, Санкт-Петербург, ул. Малая Садовая, д. 1, тел.: +7 (812) 570-60-78



Н. С. Григорьева
Центр гигиены и эпидемиологии в городе Санкт-Петербурге, Российская Федерация
Россия
врач-бактериолог, заведующая бактериологической лабораторией Центра гигиены и эпидемиологии в городе Санкт-Петербурге Адрес: 192102, Санкт-Петербург, Волковский проспект, д. 77, тел.: +7 (812) 490-57-76


Е. В. Кича
Центр гигиены и эпидемиологии в городе Санкт-Петербурге, Российская Федерация
Россия
врач-бактериолог бактериологической лаборатории Центра гигиены и эпидемиологии в городе Санкт-Петербурге Адрес: 192102, Санкт-Петербург, Волковский проспект, д. 77, тел.: +7 (812) 405-75-14


Г. В. Забалуева
Центр гигиены и эпидемиологии в городе Санкт-Петербурге, Российская Федерация
Россия

врач-бактериолог, заведующая лабораторией особо опасных и вирусологических исследований Центра гигиены и эпидемиологии в городе Санкт-Петербурге Адрес: 198099, Санкт-Петербург, ул. Оборонная, д. 35, лит. А, тел.: +7 (812) 786-87-00



Т. Б. Кутасова
Центр гигиены и эпидемиологии в городе Санкт-Петербурге, Российская Федерация
Россия

врач-эпидемиолог, заведующая отделом эпидемиологии инфекционных и особо опасных заболеваний Центра гигиены и эпидемиологии в городе Санкт-Петербурге Адрес: 191023, Санкт-Петербург, ул. Малая Садовая, д. 1, тел.: +7 (812) 570-60-87



Ю. Н. Коржаев
Центр гигиены и эпидемиологии в городе Санкт-Петербурге, Российская Федерация
Россия

главный врач Центра гигиены и эпидемиологии в городе Санкт-Петербурге Адрес: 191023, Санкт-Петербург, ул. Малая Садовая, д. 1, тел.: +7 (812) 570-38-11



Н. С. Башкетова
Управление Роспотребнадзора по городу Санкт-Петербургу, Российская Федерация
Россия
заместитель руководителя Управления Роспотребнадзора по городу Санкт- Петербургу Адрес: 191025, Санкт-Петербург, ул. Стремянная, д. 19, тел.: +7 (812) 764-54-38


О. Н. Бушманова
Управление Роспотребнадзора по городу Санкт-Петербургу, Российская Федерация
Россия

главный специалист-эксперт Управления Роспотребнадзора по городу Санкт- Петербургу Адрес: 191025, Санкт-Петербург, ул. Стремянная, д. 19, тел.: +7 (812) 764-55-87



А. В. Сталевская
Управление Роспотребнадзора по городу Санкт-Петербургу, Российская Федерация
Россия
кандидат медицинских наук, заместитель руководителя Управления Роспотребнад- зора по городу Санкт-Петербургу Адрес: 191025, Санкт-Петербург, ул. Стремянная, д. 19, тел.: +7 (812) 764-58-77


И. Г. Чхинджерия
Управление Роспотребнадзора по городу Санкт-Петербургу, Российская Федерация
Россия
начальник отдела эпидемиологического надзора Управления Роспотребнадзора по городу Санкт-Петербургу Адрес: 191025, Санкт-Петербург, ул. Стремянная, д. 19, тел.: +7 (812) 575-81-04


А. Б. Жебрун
НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, Санкт-Петербург, Российская Федерация
Россия
доктор медицинских наук, профессор, член-корреспондент РАН, директор НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера Адрес: 197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14, тел.: +7 (812) 313-69-88


Список литературы

1. Svetoch E.A., Stepanshin Yu.G., Manzenyuk I.N., Stepanov A.V., Khramov M.V., Rudnitskii S.Yu., Borzenkov V.N., Eruslanov B.V., Shobukhova T.S., Lobkovskii A.G., Bezobrazova S.V., Popova T.A. Sensitivity of Escherichia coli O157: H7, the causative agent of hemorrhagic colitis, antimicrobial. Antibiotiki i khimioterapiya = Antibiotics and chemotherapy. 1998; 43 (11): 16–20.

2. Kaftyreva L.A., Makarova M.A., Konovalova T.A., Matveeva Z.N. Characteristics of enterohaemorrhagic Escherichia coli O145: H28 isolated from patients with hemolytic-uremic syndrome. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunologii = Journal of microbiology, epidemiology and immunology. 2013; 5: 100 104.

3. Padhye N.V., Doyle M.P. Escherichia coli O157:H7 epidemiology, pathogenesis and methods for detection in food. J. Food Protect. 1992; 55: 555–565.

4. Garg A.X., Suri R.S., Barrowman N., Rehman F., Matsell D., Rosas-Arellano M.P., Salvadori M., Haynes R.B., Clark W.F. Long-term renal prognosis of diarrhea-associated hemolytic uremic syndrome: a systematic review, meta-analysis, and meta-regression. JAMA. 2003; 290 (10): 1360–1370.

5. Karch H., Tarr P.I., Bielaszewska M. Enterohaemorrhagic Escherichia coli in human medicine. Int. J. Med. Microbiol. 2005; 295 (6–7): 405–418.

6. Soon J.M., Seaman P., Baines R.N. Escherichia coli O104:H4 outbreak from sprouted seeds. Int. J. Hyg. Environ. Health. 2012; 216 (3): 346–354.

7. Brooks J.T., Sowers E.G., Wells J.G., Greene K.D., Griffin P.M., Hoekstra R.M., Strockbine N.A. Non-O157 Shiga toxin-producing Escherichia coli infections in the United States, 1983–2002. J. Infect. Dis. 2005; 192 (8): 1422–1429.

8. Manning S.D., Motiwala A.S., Springman A.C. Variation in virulence among clades of Escherichia coli O157:H7 associated with disease outbreaks. Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 2008; 105: 4868–4873.

9. Tilden J., Jr., Young W., McNamara A.M., Custer C., Boesel B., Lambert-Fair M.A., Majkowski J., Vugia D., Werner S.B., Hollingsworth J., Morris J.G., Jr. A new route of transmission for Escherichia coli: infection from dry fermented salami. Am. J. Public. Health. 1996; 86 (8): 1142–1145.

10. Machado J., Grimont F., Grimont P.A. Identification of Escherichia coli flagellar types by restriction of the amplified fliC gene. Res Microbiol. 2000; 151 (7): 535–546.

11. Verevkin V.V., Volozhantsev N.V., Stepanshin Yu.G., Svetoch E.A, Myakinina V.P. Shtamm bakteriofaga Escherichia coli V32 dlya identifikatsii bakterii Escherichia coli serogruppy O157. Patent RU № 2425877. Zayavka: 2010106806/10, 26.02.2010, opubl. 10.08.2011. Byull. № 22 [Bacteriophage strain Escherichia coli V32 for identifying bacteria Escherichia coli O157 serogroup. Patent RU № 2425877. Application: 2010106806/10, 26.02.2010, publ. 10.08.2011. Bull. Number 22].

12. Friedrich A.W., Bielaszewska M., Zhang W.L., Pulz M., Kuczius T., Ammon A., Karch H. Escherichia coli harboring Shiga toxin 2 gene variants: frequency and association with clinical symptoms. J. Infect. Dis. 2002; 185 (1): 74–84.

13. Zhang W.L., Kohler B., Oswald E., Beutin L., Karch H., Morabito S., Caprioli A., Suerbaum S., Schmidt H. Genetic diversity of intimin genes of attaching and effacing Escherichia coli strains. J. Clin. Microbiol. 2002; 40: 4486–4492.

14. Ramachandran V., Brett K., Hornitzky M.A., Dowton M., Bet-telheim K.A., Walker M.J., Djordjevic S.P. Distribution of intimin subtypes among Escherichia coli isolates from ruminant and human sources. J. Clin. Microbiol. 2003; 41: 5022–5032.

15. Cookson A.L., Cao M., Bennett J., Nicol C., Thomson-Carter F., Attwood G.T. Relationship between virulence gene profiles of atypical enteropathogenic Escherichia coli and Shiga toxin-producing E. coli isolates from cattle and sheep in New Zealand. Appl. Environ. Microbiol. 2010; 76 (11): 3744–3747.

16. Centers for Disease Control and Prevention. 2002–2003 Foodnet population survey. URL: http://www.cdc.gov/foodnet/surveys/ pop/2002/2002Atlas.pdf Accessed 15 December 2009.

17. Perelle S., Dilasser F., Grout J., Fach P. Screening food raw materials for the presence of the world’s most frequent clinical cases of Shiga toxin-encoding Escherichia coli O26, O103, O111, O145 and O157. Int. J. Food Microbiol. 2007; 113 (3): 284–288.

18. Nyholm O., Heinikainen S., Pelkonen S., Hallanvuo S., Haukka K., Siitonen A. Hybrids of Shigatoxigenic and Enterotoxigenic Escherichia coli (STEC/ETEC) Among Human and Animal Isolates in Finland. Zoonoses Public Health. 2015. Doi: 10.1111/zph.12177 [Epub ahead of print].

19. Weisbecker A. A legal history of raw milk in the United States. J. Environ. Health. 2007; 69 (8): 62–63.


Для цитирования:


Онищенко Г.Г., Дятлов И.А., Светоч Э.А., Воложанцев Н.В., Баннов В.А., Карцев Н.Н., Борзенков В.Н., Фурсова Н.К., Шемякин И.Г., Богун А.Г., Кисличкина А.А., Попова А.В., Мякинина В.П., Теймуразов М.Г., Полосенко О.В., Кафтырева Л.А., Макарова М.А., Матвеева З.Н., Гречанинова Т.А., Григорьева Н.С., Кича Е.В., Забалуева Г.В., Кутасова Т.Б., Коржаев Ю.Н., Башкетова Н.С., Бушманова О.Н., Сталевская А.В., Чхинджерия И.Г., Жебрун А.Б. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШИГА-ТОКСИН-ПРОДУЦИРУЮЩИХ ESCHERICHIA COLI, ВЫДЕЛЕННЫХ ПРИ ВСПЫШКЕ ПИЩЕВОЙ ИНФЕКЦИИ В САНКТ-ПЕТЕРБУРГЕ В 2013 ГОДУ. Вестник Российской академии медицинских наук. 2015;70(1):70-81. https://doi.org/10.15690/vramn.v70i1.1234

For citation:


Onishchenko G.G., Dyatlov I.A., Svetoch E.A., Volozhantsev N.V., Bannov V.A., Kartsev N.N., Borzenkov V.N., Fursova N.K., Shemyakin I.G., Bogun A.G., Kislichkina A.A., Popova A.V., Myakinina V.P., Teimurazov M.G., Polosenko O.V., Kaftyreva L.A., Makarova M.A., Matveeva Z.N., Grechaninova T.A., Grogor'eva N.S., Kicha E.V., Zabalueva G.V., Kutasova T.B., Korzhaev Y.N., Bashketova N.S., Bushmanova O.N., Stalevskaya A.V., Chkhindzheriya I.G., Zhebrun A.B. MOLECULAR-GENETIC CHARACTERIZATION OF SHIGA-TOXIN PRODUCING ESCHERICHIA COLI ISOLATED DURING A FOOD-BORNE OUTBREAK IN ST. PETERSBURG IN 2013. Annals of the Russian academy of medical sciences. 2015;70(1):70-81. (In Russ.) https://doi.org/10.15690/vramn.v70i1.1234

Просмотров: 215


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0869-6047 (Print)
ISSN 2414-3545 (Online)