MOLECULAR-GENETIC CHARACTERIZATION OF SHIGA-TOXIN PRODUCING ESCHERICHIA COLI ISOLATED DURING A FOOD-BORNE OUTBREAK IN ST. PETERSBURG IN 2013

G. G. Onishchenko; Онищенко Г. Г.; I. A. Dyatlov; Дятлов И. А.; E. A. Svetoch; Светоч Э. А.; N. V. Volozhantsev; Воложанцев Н. В.; V. A. Bannov; Баннов В. А.; N. N. Kartsev; Карцев Н. Н.; V. N. Borzenkov; Борзенков В. Н.; N. K. Fursova; Фурсова Н. К.; I. G. Shemyakin; Шемякин И. Г.; A. G. Bogun; Богун А. Г.; A. A. Kislichkina; Кисличкина А. А.; A. V. Popova; Попова А. В.; V. P. Myakinina; Мякинина В. П.; M. G. Teimurazov; Теймуразов М. Г.; O. V. Polosenko; Полосенко О. В.; L. A. Kaftyreva; Кафтырева Л. А.; M. A. Makarova; Макарова М. А.; Z. N. Matveeva; Матвеева З. Н.; T. A. Grechaninova; Гречанинова Т. А.; N. S. Grogor'eva; Григорьева Н. С.; E. V. Kicha; Кича Е. В.; G. V. Zabalueva; Забалуева Г. В.; T. B. Kutasova; Кутасова Т. Б.; Yu. N. Korzhaev; Коржаев Ю. Н.; N. S. Bashketova; Башкетова Н. С.; O. N. Bushmanova; Бушманова О. Н.; A. V. Stalevskaya; Сталевская А. В.; I. G. Chkhindzheriya; Чхинджерия И. Г.; A. B. Zhebrun; Жебрун А. Б.

doi:10.15690/vramn.v70i1.1234

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШИГА-ТОКСИН-ПРОДУЦИРУЮЩИХ ESCHERICHIA COLI, ВЫДЕЛЕННЫХ ПРИ ВСПЫШКЕ ПИЩЕВОЙ ИНФЕКЦИИ В САНКТ-ПЕТЕРБУРГЕ В 2013 ГОДУ

Авторы: Онищенко Г.Г.¹, Дятлов И.А.², Светоч Э.А.², Воложанцев Н.В.², Баннов В.А.², Карцев Н.Н.², Борзенков В.Н.², Фурсова Н.К.², Шемякин И.Г.², Богун А.Г.², Кисличкина А.А.², Попова А.В.², Мякинина В.П.², Теймуразов М.Г.², Полосенко О.В.², Кафтырева Л.А.³, Макарова М.А.³, Матвеева З.Н.³, Гречанинова Т.А.⁴, Григорьева Н.С.⁴, Кича Е.В.⁴, Забалуева Г.В.⁴, Кутасова Т.Б.⁴, Коржаев Ю.Н.⁴, Башкетова Н.С.⁵, Бушманова О.Н.⁵, Сталевская А.В.⁵, Чхинджерия И.Г.⁵, Жебрун А.Б.³
Учреждения:
1. Правительство Российской Федерации, Москв
2. ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Российская Федерация
3. НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, Санкт-Петербург, Российская Федерация
4. Центр гигиены и эпидемиологии в городе Санкт-Петербурге, Российская Федерация
5. Управление Роспотребнадзора по городу Санкт-Петербургу, Российская Федерация
Выпуск: Том 70, № 1 (2015)
Страницы: 70-81
Раздел: АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ МИКРОБИОЛОГИИ
Дата публикации: 28.01.2015
URL: https://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/article/view/74
DOI: https://doi.org/10.15690/vramn.v70i1.1234
ID: 74

Цитировать

Полный текст

Аннотация
Об авторах
Список литературы
Дополнительные файлы
Статистика

Аннотация

Пищевые инфекции, вызываемые шига-токсин-продуцирующими штаммами Escherichia coli (STEC), регистрируются во многих странах мира и представляют серьезную проблему для общественного здравоохранения. Сведений об эпидемиологии, этиологической структуре STEC-инфекций и молекулярно-генетических особенностях STEC-патогенов в Российской Федерации крайне недостаточно. Цель исследования: изучить вспышку пищевой инфекции в форме геморрагического колита (ГК) с гемолитико-уремическим синдромом (ГУС), энтероколита и острого гастроэнтерита среди детей в г. Санкт-Петербурге в 2013 г. Методы: в работе использованы эпидемиологические, микробиологические, молекулярно-генетические и биоинформационные методы анализа. Результаты: объектами исследования послужили образцы клинического материала, пробы молока и пищевых продуктов, а также штаммы STEC, выделенные во время вспышки пищевой инфекции. Установлено, что вспышка пищевой инфекции была вызвана потреблением сырого молока, обсемененного STEC, что подтверждено данными эпидемиологического анализа, выявлением в пробах молока ДНК STEC и выделением возбудителей из испражнений больных детей и из проб молока. Данные полногеномного секвенирования показали, что описываемая вспышка была вызвана двумя группами патогенов: E. coli O157:H7 и E. coli О101:H33. Штаммы первой группы отнесены к ранее известному сиквенс-типу — ST24, второй группы — к ранее не описанному ST145, зарегистрированному нами в базе данных shigatox.net. В геномах штаммов обеих групп присутствуют нуклеотидные последовательности VT2-подобных профагов с интегрированными в них генами stx2_с и нуклеотидные последовательности плазмид с генами энтерогемолизинов, а также гены синтеза основного фактора адгезии EHEC интимина: в группе E. coli O157:H7 — интимина гамма, а в группе E. coli O101:H33 — интимина йота 2, до настоящей работы обнаруженного только в группе энтеропатогенных эшерихий (EPEC). Заключение: пополнение знаний по эпидемиологии и биологии возбудителей STEC-инфекций позволит усовершенствовать диагностику, лечении и профилактике геморрагического колита.

Ключевые слова

энтерогеморрагические Escherichia coli (EHEC), шига-токсин продуцирующие Escherichia coli (STEC), гены шига-токсинов, ген интимина, серотипирование, мультилокусное сиквенс-типирование (MLST), полногеномное секвенирование

Об авторах

Г. Г. Онищенко

Правительство Российской Федерации, Москв

Автор, ответственный за переписку.
Email: onishchenko_gg@aprf.gov.ru

доктор медицинских наук, профессор, академик РАН, помощник Председателя Правительства Российской Федерации
Адрес: 103274, Москва, Краснопресненская наб., д. 2, стр. 2, тел.: +7 (495) 985-54-86

Россия