Сравнительное генетическое типирование изолятов Staphylococcus aureus, выделенных с поверхности кожи, из носовой полости и кишечника у детей, страдающих атопическим дерматитом

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Обоснование. Кожные покровы больных, страдающих атопическим дерматитом, с большой частотой колонизированы бактериями, принадлежащими виду Staphylococcus aureus. Топическая антибактериальная и противовоспалительная терапия часто оказываются недостаточно эффективными, что проявляется реколонизацией кожных покровов золотистым стафилококком и обострением аллергического процесса.

Цель исследования: определить частоту колонизации S. aureus кожных покровов, слизистых оболочек носовой полости и кишечника у детей, страдающих атопическим дерматитом, провести сравнительный анализ выделенных из различных биотопов штаммов S. aureus, используя методы генетического типирования, и на основании полученных результатов оценить вероятность миграции стафилококков между биотопами.

Методы. Выделение S. aureus проведено у 38 детей с атопическим дерматитом. Осуществляли видовую идентификацию стафилококков при помощи биохимических (API Staph) и масс-спектрометрических (MALDI-TOF MS) методов. Генетическое типирование выделенных штаммов S. aureus проводилось методами анализа длин участков между генами 16S рРНК и 23S рРНК в многокопийных рРНК-оперонах и высокоразрешающего анализа плавления региона Х гена spa.

Результаты. При помощи MALDI-TOF масс-спектрометрии были успешно идентифицированы 99% выделенных штаммов S. aureus: у 31,6% детей ― из всех изучаемых биотопов, у 42% ― с поверхности кожи и из носовой полости, у 2,6% ― с кожи и из кишечника, у 10,5% ― только с кожи, у 2,6% ― из носовой полости и кишечника, у 2,6% ― только из носовой полости. У 8% детей S. aureus не был обнаружен ни в одном из биотопов. Генотипирование позволило выявить 17 отличающихся генотипов S. aureus. Генотипы S. aureus, выделенные из носовой полости и кишечника, были в 88 и 61% случаев соответственно идентичны генотипу S. aureus, обнаруженному на кожных покровах.

Заключение. Высокая частота совпадений генотипов свидетельствует о возможности миграции S. aureus между биотопами в организме человека и об отсутствии выраженной специализации штаммов S. aureus к колонизации какого-либо одного из них.

Об авторах

А. П. Пикина

Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова

Автор, ответственный за переписку.
Email: apikina@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-7232-3288

старший преподаватель кафедры микробиологии и вирусологии,

117997, Москва, ул. Островитянова, д. 1

Россия

А. Н. Шкопоров

Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова

Email: a.shkoporov@gmail.com

кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории микробиологии и биобезопасности,

117997, Москва, ул. Островитянова, д. 1

Е. В. Кулагина

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта

Email: elenka176@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-5381-1785

научный сотрудник,

119991, Москва, ул. Вавилова, д. 32

Е. В. Хохлова

Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова

Email: a.shkoporov@gmail.com

научный сотрудник лаборатории микробиологии и биобезопасности,

117997, Москва, ул. Островитянова, д. 1

А. В. Чаплин

Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова

Email: okolomedik@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-1377-7153

ассистент кафедры микробиологии и вирусологии,

117997, Москва, ул. Островитянова, д. 1

Н. Н. Володин

Федеральный научно-клинический центр детской гематологии, онкологии и иммунологии им. Д. Рогачёва

Email: info@fnkc.ru

доктор медицинских наук, академик РАМН, профессор,

117997, Москва, ул. Саморы Машела, д. 1

Л. И. Кафарская

Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова

Email: likmed@mail.ru

доктор медицинских наук, профессор, заведующая кафедрой микробиологии и вирусологии,

117997, Москва, ул. Островитянова, д. 1

Н. Г. Короткий

Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова

Email: korotkiy_ng@rsmu.ru

доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой дерматовенерологии,

117997, Москва, Ленинский проспект, д. 117

Б. А. Ефимов

Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова

Email: efimov_ba@mail.ru

доктор медицинских наук, профессор кафедры микробиологии и вирусологии,

117997, Москва, ул. Островитянова, д. 1

Список литературы

  1. Семенов В.Ю., Руголь Л.В., Матвеев Э.Н. Повозрастные показатели нуждаемости детского населения в специализированной стационарной медицинской помощи на примере Московской области // Социальные аспекты здоровья населения. ― 2010. ― T.16. ― №4 ― C. 10. [Semenov VYu, Rugol LV, Matveev EN. Age-related indicators of children population’s needs in the specialized stationary medical care by an example of the Moscow region. Sotsial’nye aspekty zdorov’ya naseleniya. 2010;16(4):10. (In Russ).]
  2. Bieber T. Atopic dermatitis. Ann Dermatol. 2010;22(2):125–137. doi: 10.5021/ad.2010.22.2.125.
  3. Leung DY. New insights into atopic dermatitis: role of skin barrier and immune dysregulation. Allergol Int. 2013;62(2):151−161. doi: 10.2332/allergolint.13-RAI-0564.
  4. Ефимов Б.А., Короткий Н.Г., Постникова Е.А. и др. Изучение качественного состава стафилококков кожи у больных атопическим дерматитом // Стерилизация и госпитальные инфекции. ― 2007. ― T.3. ― №5 ― C. 17–20. [Efimov BA, Korotkii NG, Postnikova EA, et al. Izuchenie kachestvennogo sostava stafilokokkov kozhi u bol’nykh atopicheskim dermatitom. Sterilizatsiya i gospital’nye infektsii. 2007;3(5):17−20. (In Russ).]
  5. Mempel M. Staphylococcus aureus and atopic eczema. In: Ring JPB, Przybilla B, Ruzicka T, editors. Handbook of atopic eczema. Berlin: Springer Science & Business; 2006. p. 406–409.
  6. Park HY, Kim CR, Huh IS, et al. Staphylococcus aureus colonization in acute and chronic skin lesions of patients with atopic dermatitis. Ann Dermatol. 2013;25(4):410–416. doi: 10.5021/ad.2013.25.4.410.
  7. Gilani SJ, Gonzalez M, Hussain I, et al. Staphylococcus aureus recolonization in atopic dermatitis: beyond the skin. Clin Exp Dermatol. 2005;30(1):10–13. doi: 10.1111/j.1365-2230.2004.01679.x.
  8. Elias PM, Schmuth M. Abnormal skin barrier in the etiopathogenesis of atopic dermatitis. Curr Allergy Asthma Rep. 2009;9(4):265–272. doi: 10.1007/s11882-009-0037-y.
  9. Arisawa T, Arisawa S, Yokoi T, et al. Endoscopic and histological features of the large intestine in patients with atopic dermatitis. J Clin Biochem Nutr. 2007;40(1):24–30. doi: 10.3164/jcbn.40.24.
  10. Stephens AJ, Inman-Bamber J, Giffard PM, Huygens F. Highresolution melting analysis of the spa repeat region of Staphylococcus aureus. Clin Chem. 2008;54(2):432–436. doi: 10.1373/clinchem.2007.093658.
  11. Gürtler V, Barrie HD, Mayall BC. Use of denaturing gradient gel electrophoresis to detect mutation in VS2 of the 16S-23S rDNA spacer amplified from Staphylococcus aureus isolates. Electrophoresis. 2001;22(10):1920−1924. doi: 10.1002/1522-2683(200106)22:10<1920::aid-elps1920>3.0.co;2-0.
  12. Saruta K, Matsunaga T, Kono M, et al. Rapid identification and typing of Staphylococcus aureus by nested PCR amplified ribosomal DNA spacer region. FEMS Microbiol Lett. 1997;146(2):271–278. doi: 10.1016/s0378-1097(96)00487-9.
  13. Nomura F. Proteome-based bacterial identification using matrixassisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS): A revolutionary shift in clinical diagnostic microbiology. Biochim Biophys Acta. 2015;1854(6):528–537. doi: 10.1016/j.bbapap.2014.10.022.
  14. Zhu W, Sieradzki K, Albrecht V, et al. Evaluation of the Biotyper MALDI-TOF MS system for identification of Staphylococcus species. J Microbiol Methods. 2015;117:14–17. doi: 10.1016/j.mimet.2015.07.014.
  15. Good P. Permutation tests: a practical guide to resampling methods for testing hypotheses. Springer series in statistics. New York: Springer Science & Business Media; 2013. 228 p.
  16. Kim BS, Park JY, Song CH, et al. Clarifying the transmission route of Staphylococcus aureus colonizing the skin in early childhood atopic dermatitis. Ann Allergy Asthma Immunol. 2012;109(6):448–453. doi: 10.1016/j.anai.2012.09.015.
  17. Bonness S, Szekat C, Novak N, Bierbaum G. Pulsed-field gel electrophoresis of Staphylococcus aureus isolates from atopic patients revealing presence of similar strains in isolates from children and their parents. J Clin Microbiol. 2008;46(2):456–461. doi: 10.1128/JCM.01734-07.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Издательство "Педиатръ", 2016



Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах