Отправить статью по E-mail 
Сравнительное генетическое типирование изолятов Staphylococcus aureus, выделенных с поверхности кожи, из носовой полости и кишечника у детей, страдающих атопическим дерматитом
- Авторы: Пикина А.П.1, Шкопоров А.Н.1, Кулагина Е.В.2, Хохлова Е.В.1, Чаплин А.В.1, Володин Н.Н.3, Кафарская Л.И.1, Короткий Н.Г.1, Ефимов Б.А.1
-
Учреждения:
- Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова
- Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта
- Федеральный научно-клинический центр детской гематологии, онкологии и иммунологии им. Д. Рогачёва
- Выпуск: Том 71, № 5 (2016)
- Страницы: 367-374
- Раздел: АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ МИКРОБИОЛОГИИ
- Дата публикации: 24.10.2016
- URL: https://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/article/view/695
- DOI: https://doi.org/10.15690/vramn695
- ID: 695
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Обоснование. Кожные покровы больных, страдающих атопическим дерматитом, с большой частотой колонизированы бактериями, принадлежащими виду Staphylococcus aureus. Топическая антибактериальная и противовоспалительная терапия часто оказываются недостаточно эффективными, что проявляется реколонизацией кожных покровов золотистым стафилококком и обострением аллергического процесса.
Цель исследования: определить частоту колонизации S. aureus кожных покровов, слизистых оболочек носовой полости и кишечника у детей, страдающих атопическим дерматитом, провести сравнительный анализ выделенных из различных биотопов штаммов S. aureus, используя методы генетического типирования, и на основании полученных результатов оценить вероятность миграции стафилококков между биотопами.
Методы. Выделение S. aureus проведено у 38 детей с атопическим дерматитом. Осуществляли видовую идентификацию стафилококков при помощи биохимических (API Staph) и масс-спектрометрических (MALDI-TOF MS) методов. Генетическое типирование выделенных штаммов S. aureus проводилось методами анализа длин участков между генами 16S рРНК и 23S рРНК в многокопийных рРНК-оперонах и высокоразрешающего анализа плавления региона Х гена spa.
Результаты. При помощи MALDI-TOF масс-спектрометрии были успешно идентифицированы 99% выделенных штаммов S. aureus: у 31,6% детей ― из всех изучаемых биотопов, у 42% ― с поверхности кожи и из носовой полости, у 2,6% ― с кожи и из кишечника, у 10,5% ― только с кожи, у 2,6% ― из носовой полости и кишечника, у 2,6% ― только из носовой полости. У 8% детей S. aureus не был обнаружен ни в одном из биотопов. Генотипирование позволило выявить 17 отличающихся генотипов S. aureus. Генотипы S. aureus, выделенные из носовой полости и кишечника, были в 88 и 61% случаев соответственно идентичны генотипу S. aureus, обнаруженному на кожных покровах.
Заключение. Высокая частота совпадений генотипов свидетельствует о возможности миграции S. aureus между биотопами в организме человека и об отсутствии выраженной специализации штаммов S. aureus к колонизации какого-либо одного из них.
Ключевые слова
Об авторах
А. П. Пикина
Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова
Автор, ответственный за переписку.
Email: apikina@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-7232-3288
старший преподаватель кафедры микробиологии и вирусологии,
117997, Москва, ул. Островитянова, д. 1
РоссияА. Н. Шкопоров
Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова
Email: a.shkoporov@gmail.com
кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории микробиологии и биобезопасности,
117997, Москва, ул. Островитянова, д. 1
Е. В. Кулагина
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта
Email: elenka176@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-5381-1785
научный сотрудник,
119991, Москва, ул. Вавилова, д. 32
Е. В. Хохлова
Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова
Email: a.shkoporov@gmail.com
научный сотрудник лаборатории микробиологии и биобезопасности,
117997, Москва, ул. Островитянова, д. 1
А. В. Чаплин
Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова
Email: okolomedik@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-1377-7153
ассистент кафедры микробиологии и вирусологии,
117997, Москва, ул. Островитянова, д. 1
Н. Н. Володин
Федеральный научно-клинический центр детской гематологии, онкологии и иммунологии им. Д. Рогачёва
Email: info@fnkc.ru
доктор медицинских наук, академик РАМН, профессор,
117997, Москва, ул. Саморы Машела, д. 1
Л. И. Кафарская
Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова
Email: likmed@mail.ru
доктор медицинских наук, профессор, заведующая кафедрой микробиологии и вирусологии,
117997, Москва, ул. Островитянова, д. 1
Н. Г. Короткий
Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова
Email: korotkiy_ng@rsmu.ru
доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой дерматовенерологии,
117997, Москва, Ленинский проспект, д. 117
Б. А. Ефимов
Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова
Email: efimov_ba@mail.ru
доктор медицинских наук, профессор кафедры микробиологии и вирусологии,
117997, Москва, ул. Островитянова, д. 1
Список литературы
- Семенов В.Ю., Руголь Л.В., Матвеев Э.Н. Повозрастные показатели нуждаемости детского населения в специализированной стационарной медицинской помощи на примере Московской области // Социальные аспекты здоровья населения. ― 2010. ― T.16. ― №4 ― C. 10. [Semenov VYu, Rugol LV, Matveev EN. Age-related indicators of children population’s needs in the specialized stationary medical care by an example of the Moscow region. Sotsial’nye aspekty zdorov’ya naseleniya. 2010;16(4):10. (In Russ).]
- Bieber T. Atopic dermatitis. Ann Dermatol. 2010;22(2):125–137. doi: 10.5021/ad.2010.22.2.125.
- Leung DY. New insights into atopic dermatitis: role of skin barrier and immune dysregulation. Allergol Int. 2013;62(2):151−161. doi: 10.2332/allergolint.13-RAI-0564.
- Ефимов Б.А., Короткий Н.Г., Постникова Е.А. и др. Изучение качественного состава стафилококков кожи у больных атопическим дерматитом // Стерилизация и госпитальные инфекции. ― 2007. ― T.3. ― №5 ― C. 17–20. [Efimov BA, Korotkii NG, Postnikova EA, et al. Izuchenie kachestvennogo sostava stafilokokkov kozhi u bol’nykh atopicheskim dermatitom. Sterilizatsiya i gospital’nye infektsii. 2007;3(5):17−20. (In Russ).]
- Mempel M. Staphylococcus aureus and atopic eczema. In: Ring JPB, Przybilla B, Ruzicka T, editors. Handbook of atopic eczema. Berlin: Springer Science & Business; 2006. p. 406–409.
- Park HY, Kim CR, Huh IS, et al. Staphylococcus aureus colonization in acute and chronic skin lesions of patients with atopic dermatitis. Ann Dermatol. 2013;25(4):410–416. doi: 10.5021/ad.2013.25.4.410.
- Gilani SJ, Gonzalez M, Hussain I, et al. Staphylococcus aureus recolonization in atopic dermatitis: beyond the skin. Clin Exp Dermatol. 2005;30(1):10–13. doi: 10.1111/j.1365-2230.2004.01679.x.
- Elias PM, Schmuth M. Abnormal skin barrier in the etiopathogenesis of atopic dermatitis. Curr Allergy Asthma Rep. 2009;9(4):265–272. doi: 10.1007/s11882-009-0037-y.
- Arisawa T, Arisawa S, Yokoi T, et al. Endoscopic and histological features of the large intestine in patients with atopic dermatitis. J Clin Biochem Nutr. 2007;40(1):24–30. doi: 10.3164/jcbn.40.24.
- Stephens AJ, Inman-Bamber J, Giffard PM, Huygens F. Highresolution melting analysis of the spa repeat region of Staphylococcus aureus. Clin Chem. 2008;54(2):432–436. doi: 10.1373/clinchem.2007.093658.
- Gürtler V, Barrie HD, Mayall BC. Use of denaturing gradient gel electrophoresis to detect mutation in VS2 of the 16S-23S rDNA spacer amplified from Staphylococcus aureus isolates. Electrophoresis. 2001;22(10):1920−1924. doi: 10.1002/1522-2683(200106)22:10<1920::aid-elps1920>3.0.co;2-0.
- Saruta K, Matsunaga T, Kono M, et al. Rapid identification and typing of Staphylococcus aureus by nested PCR amplified ribosomal DNA spacer region. FEMS Microbiol Lett. 1997;146(2):271–278. doi: 10.1016/s0378-1097(96)00487-9.
- Nomura F. Proteome-based bacterial identification using matrixassisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS): A revolutionary shift in clinical diagnostic microbiology. Biochim Biophys Acta. 2015;1854(6):528–537. doi: 10.1016/j.bbapap.2014.10.022.
- Zhu W, Sieradzki K, Albrecht V, et al. Evaluation of the Biotyper MALDI-TOF MS system for identification of Staphylococcus species. J Microbiol Methods. 2015;117:14–17. doi: 10.1016/j.mimet.2015.07.014.
- Good P. Permutation tests: a practical guide to resampling methods for testing hypotheses. Springer series in statistics. New York: Springer Science & Business Media; 2013. 228 p.
- Kim BS, Park JY, Song CH, et al. Clarifying the transmission route of Staphylococcus aureus colonizing the skin in early childhood atopic dermatitis. Ann Allergy Asthma Immunol. 2012;109(6):448–453. doi: 10.1016/j.anai.2012.09.015.
- Bonness S, Szekat C, Novak N, Bierbaum G. Pulsed-field gel electrophoresis of Staphylococcus aureus isolates from atopic patients revealing presence of similar strains in isolates from children and their parents. J Clin Microbiol. 2008;46(2):456–461. doi: 10.1128/JCM.01734-07.
Дополнительные файлы
