ПРОВЕРКА ВЗАИМОСВЯЗИ МЕЖДУ ДЕВЯТЬЮ ОДНОНУКЛЕОТИДНЫМИ ПОЛИМОРФИЗМАМИ И ИНФАРКТОМ МИОКАРДА НА СИБИРСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель исследования – проверить однонуклеотидные полиморфизмы, идентифицированные в недавних полногеномных ассоциативных исследованиях, на пригодность в качестве маркеров риска развития инфаркта миокарда в сибирской популяции. Группа больных инфарктом миокарда и контрольная группа (соотношение 1:2) были сформированы на основе популяционной выборки 45–69-летних жителей Новосибирска (9400 человек), созданной в рамках международного проекта HAPIEE (Health, Alcohol and Psychosocial factors In Eastern Europe). В исследование было включено 200 больных инфарктом миокарда (129 мужчин, 71 женщина), контрольную группу составили лица без инфаркта (420 человек), сопоставимые по половым и возрастным различиям. Геномную ДНК выделяли из венозной крови методом фенол-хлороформной экстракции. Полиморфизм генов тестировали посредством ПЦР в реальном времени в соответствии с протоколом фирмы производителя (зонды TaqMan, Applied Biosystems, США) на приборе ABI 7900HT. В исследование были включены следующие однонуклеотидные полиморфизмы: rs28711149, rs499818, rs619203, rs10757278 и rs1333049 (хр. 9), rs1376251, rs2549513, rs4804611, rs17465637. Для 4 из 9 исследованных однонуклеотидных полиморфизмов была подтверждена их ассоциация с инфарктом миокарда: rs1333049 (хр. 9), rs10757278 (хр. 9), rs499818 (хр. 6), rs619203 гена ROS1. С частотой сердечных сокращений были взаимосвязаны полиморфизмы rs1333049 и rs10757278, с уровнем глюкозы — rs619203, rs28711149 и rs1376251, с содержанием общего холестерина и индексом атерогенности плазмы — rs28711149. Впервые на российской популяции реплицированы результаты GWAS с инфарктом миокарда ОНП rs619203, rs499818, rs1333049 и rs10757278, Эти генетические маркеры могут использоваться для оценки риска развития инфаркта миокарда на российской популяции.

 

Об авторах

В. Н. Максимов

ФГБУ «Научно-исследовательский институт терапии» СО РАМН, Новосибирск
ГБОУ ВПО Новосибирский государственный медицинский университет Минздравсоцразвития России

Автор, ответственный за переписку.
Email: medik11@mail.ru
доктор медицинских наук, внештатный научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний НИИ терапии Сибирского отделения РАМН Адрес: 630089, Новосибирск, ул. Б. Богаткова, д. 175/1 Тел./факс: (383) 264-25-16 Россия

И. В. Куликов

ФГБУ «Научно-исследовательский институт терапии» СО РАМН, Новосибирск
Учреждение Российской академии наук «Институт цитологии и генетики» СО РАН, Новосибирск

Email: 248945@mail.ru
кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории молекулярно- генетических исследований терапевтических заболеваний НИИ терапии Сибирского отделения РАМН Адрес: 630089, Новосибирск, ул. Б. Богаткова, д. 175/1 Тел./факс: (383) 264-25-16 Россия

П. С. Орлов

Учреждение Российской академии наук «Институт цитологии и генетики» СО РАН, Новосибирск

Email: orlovpavel86@gmail.com
аспирант Института цитологии и генетики Сибирского отделения РАН Адрес: 630090, Новосибирск, пр-т Лаврентьева, д. 10 Россия

В. В. Гафаров

ФГБУ «Научно-исследовательский институт терапии» СО РАМН, Новосибирск

Email: valery.gafarov@gmail.com
доктор медицинских наук, профессор, заведующий лабораторией психологических и социологических проблем терапевтических заболеваний НИИ терапии Сибирского отделения РАМН Адрес: 630089, Новосибирск, ул. Б. Богаткова, д. 175/1 Тел./факс: (383) 264-25-16 Россия

С. К. Малютина

ФГБУ «Научно-исследовательский институт терапии» СО РАМН, Новосибирск
ГБОУ ВПО Новосибирский государственный медицинский университет Минздравсоцразвития России

Email: smalyutina@hotmail.com
доктор медицинских наук, профессор, руководитель группы неинвазивной диа- гностики лаборатории этиопатогенеза и клиники внутренних заболеваний НИИ терапии Сибирского отделения РАМН Адрес: 630089, Новосибирск, ул. Б. Богаткова, д. 175/1 Тел./факс: (383) 264-25-16 Россия

А. Г. Ромащенко

Учреждение Российской академии наук «Институт цитологии и генетики» СО РАН, Новосибирск

Email: romasch@bionet.nsc.ru
кандидат биологических наук, заведующая лабораторией молекулярных основ генетики животных Института цитологии и генетики Сибирского отделения РАН Адрес: 630090, Новосибирск, пр-т Лаврентьева, д. 10 Тел: (383) 363-49-74 Россия

М. И. Воевода

ФГБУ «Научно-исследовательский институт терапии» СО РАМН, Новосибирск
Учреждение Российской академии наук «Институт цитологии и генетики» СО РАН, Новосибирск

Email: mvoevoda@ya.ru
доктор медицинских наук, профессор, член-корреспондент РАМН, директор НИИ терапии Сибирского отделения РАМН Адрес: 630089, Новосибирск, ул. Б. Богаткова, д. 175/1 Тел./факс: (383) 264-25-16 Россия

Список литературы

  1. Horne B.D., Carlquist J.F., Muhlestein J.B. et al. Associations with myocardial infarction of six polymorphisms selected from a three-stage genome-wide association study. Am. Heart J. 2007; 154 (5): 969–975.
  2. Larson M.G., Atwood L.D., Benjamin E.J. et al. Framingham Heart Study 100K project: genome-wide associations for cardiovascular disease outcomes. BMC Med. Genet. 2007; 8 (1): 5.
  3. Ozaki K., Tanaka T. Genome-wide association study to identify single-nucleotide polymorphisms conferring risk of myocardial infarction. Methods Mol. Med. 2006; 128: 173–180.
  4. Samani N.J., Erdmann J., Hall A.S. et al. Genomewide association analysis of coronary artery disease. N. Engl. J. Med. 2007; 2357: 443–453.
  5. Van der Net J.B., Oosterveer D.M., Versmissen J. et al. Replication study of 10 genetic polymorphisms associated with coronary heart disease in a specific high-risk population with familial hypercholesterolemia. Eur. Heart J. 2008; 29 (18): 2195–2201.
  6. Hiura Y., Fukushima Y., Yuno M. et al. Validation of the association of genetic variants on chromosome 9p21 and 1q41 with myocardial infarction in a Japanese population. Circ. J. 2008; 72 (8): 1213–1217.
  7. Schunkert H., Götz A., Braund P. et al. Repeated replication and a prospective meta-analysis of the association between chromosome 9p21.3 and coronary artery disease. Circulation. 2008; 117 (13): 1675–1684.
  8. Shen G.Q., Li L., Rao S. et al. Four SNPs on chromosome 9p21 in a South Korean population implicate a genetic locus that confers high cross-race risk for development of coronary artery disease. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 2008; 28 (2): 360–365.
  9. MONICA Monograph and Multimedia Sourcebook. World,s largest study of heart disease, stroke, risk factors, and population trends 1979–2002. Ed. by Hugh Tunstall-Pedoe (with 64 other contributors for the WHO MONICA Project). WHO, Geneva. 2003. 237.
  10. Smith K., Kalcko S., Kantor Ch. . Pul's-elektroforez i metody raboty s bol'shimi molekulami DNK. Analiz genoma. Pod red. K. Deivisa (per. s angl.) [Pulse Electrophoresis and Methods of Work with Large DNA Molecules. Analysis of the Genome. Edited by K. Davis. Translated from English]. Moscow, Mir, 1990. p. 58–94.
  11. Helgadottir A., Thorleifsson G., Magnusson K.P. et al. The same sequence variant on 9p21 associates with myocardial infarction, abdominal aortic aneurysm and intracranial aneurysm. Nat. Genet. 2008, 40 (2): 217–224.
  12. Anderson C.D., Biffi A., Rost N.S. et al. Chromosome 9p21 in Ischemic Stroke. Population Structure and Meta-Analysis. Stroke. 2010, 41 (6):1123–1131
  13. Ellis K.L., Pilbrow A.P., Frampton C.M. et al. A Common Variant at Chromosome 9P21.3 Is Associated with Age of Onset of Coronary Disease but Not Subsequent Mortality. Circ. Cardiovasc. Genet. 2010; 3 (3): 286–293.
  14. Buysschaert I., Carruthers K.F., Dunbar D.R. et al. A variant at chromosome 9p21 is associated with recurrent myocardial infarction and cardiac death after acute coronary syndrome: The GRACE Genetics Study. Eur. Heart J. 2010: 31 (9): 1132–1141
  15. Shiffman D., Ellis S.G., Rowland C.M. et al. Identification of four gene variants associated with myocardial infarction. Am. J. Hum. Genet. 2005; 77: 596–605.
  16. Koch W., Hoppmann P., Schömig A., Kastrati A. Variations of specific non-candidate genes and risk of myocardial infarction: A replication study. Int. J. Cardiol. 2011; 147 (1): 38–41.
  17. Theodoraki E.V., Nikopensius T., Suhorutsenko J. et al. ROS1 Asp2213Asn polymorphism is not associated with coronary artery disease in a Greek case-control study. Clin. Chem. Lab. Med. 2009; 47 (12): 1471–1473.
  18. Yamada Y., Izawa H., Ichihara S. et al. Prediction of the risk of myocardial infarction from polymorphisms in candidate genes. N. Engl. J. Med. 2002; 347: 1916–1923.
  19. Myocardial Infarction Genetics Consortium Genome-wide association of early-onset myocardial infarction with single nucleotide polymorphisms and copy number variants. Nat. Genet. 2009; 41 (3): 334–341.
  20. Bressler J., Folsom A.R., Couper D.J. et al. Genetic variants identified in a European genome-wide association study that were found to predict incident coronary heart disease in the atherosclerosis risk in communities study. Am. J. Epidemiol. 2010; 171 (1): 14–23.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Издательство "Педиатръ", 2012



Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах