MICROEVOLUTION OF CHOLERA AGENT IN THE MODERN PERIOD
- Authors: Smirnova N.I.1, Agafonov D.A.2, Kul'shan' T.A.2, Krasnov Y.M.2, Kutyrev V.V.2
-
Affiliations:
- Russian Research Anti-Plague Institute «Microbe»
- Russian Research Anti-Plague Institute «Microbe», Saratov, Russian Federation
- Issue: Vol 69, No 7-8 (2014)
- Pages: 46-53
- Section: MICROBIOLOGY: CURRENT ISSUES
- Published:
- URL: https://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/article/view/407
- DOI: https://doi.org/10.15690/vramn.v69i7-8.1109
- ID: 407
Cite item
Full Text
Abstract
Keywords
About the authors
N. I. Smirnova
Russian Research Anti-Plague Institute «Microbe»
Author for correspondence.
Email: rusrapi@microbe.ru
PhD, professor, Head of the Microbiology Department of the Russian Research Anti-Plague Institute «Microbe»
РоссияD. A. Agafonov
Russian Research Anti-Plague Institute «Microbe», Saratov, Russian Federation
Email: rusrapi@microbe.ru
аспирант лаборатории патогенных вибрионов Российского научно-исследователь- ского противочумного института «Микроб» Адрес: 410005, Саратов, ул. Университетская, д. 46, тел: +7 (8452) 26-47-23, Россия
T. A. Kul'shan'
Russian Research Anti-Plague Institute «Microbe», Saratov, Russian Federation
Email: rusrapi@microbe.ru
кандидат медицинских наук, научный сотрудник лаборатории патогенных вибрионов Российского научно-исследовательского противочумного института «Микроб» Адрес: 410005, Саратов, ул. Университетская, д. 46, тел: +7 (8452) 26-47-23 Россия
Ya. M. Krasnov
Russian Research Anti-Plague Institute «Microbe», Saratov, Russian Federation
Email: rusrapi@microbe.ru
кандидат химических наук, заведующий лабораторией геномного и протеомного анализа Российского научно-исследовательского противочумного института «Микроб» Адрес: 410005, Саратов, ул. Университетская, д. 46, тел: +7 (8452) 26-47-23 Россия
V. V. Kutyrev
Russian Research Anti-Plague Institute «Microbe», Saratov, Russian Federation
Email: rusrapi@microbe.ru
доктор медицинских наук, профессор, академик РАМН, директор Российского научно-исследовательского противочумного института «Микроб» Адрес: 410005, Саратов, ул. Университетская, д. 46, тел: +7 (8452) 26-21-31 Россия
References
- Chun J., Grim C.J., Hasan N.A., Lee J.H., Choi S.Y., Haley B.J., Taviani E., Jeon Y.S., Kim D.W., Lee J-H., Brettin T.S., Bruce D.C., Challacombe J.F., Detter J.C., Han C.S., Munk A.A., Chertkov O., Meincke I., Saunders E., Walters R.A., Hug A., Nair G.B., Colwell R.R. Comparative genomics reveals mechanism for short-term and long-term clonal transitions in pandemic Vibrio cholerae. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2009; 106 (36): 15442–15447.
- Ali M., Lopez A. L., You Y.A., Kim Y. E., Sah B., Maskery B., Clemens J. The global burden of cholera. Bull World Health Organ. 2012; 90 (3): 209–218.
- Baneerjee R., Das B., Nair G.B., Basak S. Dynamics in genome evolution of Vibrio cholerae. Inf. Genet. Evolution. 2014; 1–10.
- Смирнова Н.И., Горяев А.А., Кутырев В.В. Эволюция генома возбудителя холеры в современный период. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2010; 4: 11–19.
- Gill D.M., Meren R. ADP-ribosylation of membrane proteins catalyzed by cholera toxin: basis of the activation of adenylate cyclase. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1978; 75: 3050–3054.
- Son M.S., Megli C.J., Kovacikova G. Qadri F., Taylor R.K. Characterization of Vibrio cholerae O1 El Tor biotype variant clinical isolates from Bangladesh and Haiti, including a molecular genetic analysis of virulence genes. J. Clin. Microbiol. 2011; 49 (11): 3739–3749.
- Safa A., Nair G. B., Kong R. Y.C. Evolution of new variants of Vibrio cholerae O1. Trends Micribiol. 2010; 18 (1): 46–54.
- Taviani E., Grim C.J., Choi J., Chun J., Haley B, Hasan N.A., Huq A., Colwell R.R. Discovery of novel Vibrio cholerae VSP-II genomic islands using comparative genomic analysis. FEMS Microbiol. Lett. 2010; 308: 130–137.
- Reimer A.R., Van Domselaar G., Stroika S., Walker M., Kent H., Tarr C., Talkington D., Rowe L., Olsen-Rasmussen M., Frace M., Sammons S., Dahourou G. A., Boncy J., Smith A. M., Mabon P., Petkau A., Graham M., Gilmour M.W., Gerner-Smidt P. Comparative genomics of Vibrio cholerae from Haiti, Asia, and Africa. Emerg. Infect. Dis. 2011; 17 (11): 2113–2121.
- Смирнова Н.И., Заднова С.П., Шашкова А.В., Кутырев В.В. Вариабельность генома измененных вариантов Vibrio cholerae биовара Эль-Тор, изолированных на территории России в современный период. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2011; 4: 11–18.
- Sanger F., Nicklen S., Coulson A. R. DNA sequencing with chainterminating inhibitors. Nature. 1977; 74 (12): 5463–5467.
- Danin-Poleg Y., Cohen L.A., Gancz H., Broza Y.Y., Goldshmidt H., Malul E., Valinsky L., Lerner L., Broza M., Kashi Y. Vibrio cholerae strain typing and phylogeny study based on simple sequence repeats. J. Clin. Microbiol. 2007; 45 (3): 736–746.
- Dziejman M., Balon E., Boyd D., Fraser C. M., Heidelberg J. F, Mekalanos J.J. Comparative genomic analysis of Vibrio cholerae: genes that correlate with cholera endemic and pandemic disease. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002; 99 (3): 1556–1561.
- Heidelberg J.F., Eisen J.A., Nelson W.C., Clayton R.A., Gwinn M.L., Dodson R.J., Haft D.H, Hickey E.K., Peterson J.D., Umayam L., Gill S.R., Nelson K.E., Read T.D., Tettelin H., Richardson D., Ermolaeva M.D., Vamathevan J., Bass S., H. Qin, Dragoi I., Sellers P., McDonald L., Utterback T., Fleishmann R.D., Nierman W.C., White O., Salzberg S.L., Smith H.O., Colwell R.R., Mekalanos J.J., Venter J.C., C.M. Fraser. DNA sequence of both chromosomes of the cholera pathogen Vibrio cholerae. Nature. 2000; 406: 477–483.
- Morita M., Ohnishi M., Arakawa E., Bhuiyan N.A., Nusrin S., Alam M., Siddique A.K., Qadri F., Izumia H., Nair G.B., Watanabe H. Development and validation of a mismatch amplification mutation PCR assay to monitor the dissemination of an emerging variant of Vibrio cholerae O1 biotype El Tor. Microbiol. Immunol. 2008; 52 (6): 314–317.
- Choi S. Y., J. H. Lee, Jeon Y. S. et al. Multilocus variable-number tandem repeat analysis of Vibrio cholerae O1 El Tor strains harbouring classical toxin B. J. Med. Microbiol, 2010; 59 (3): 763–769.