The evolution of technologies in microbiology is the key to creating new opportunities for surveillance and prevention of infections in obstetrics

Cover Page
  • Authors: Priputnevich T.V.1, Zubkov V.V.1, Trofimov D.Y.1, Shevyreva M.P.2, Maryin G.G.3, Tutelyan A.V.4, Akimkin V.G.4, Briko N.I.5, Kostenko N.A.6, Baibarina E.N.1,6, Sukhikh G.T.1
  • Affiliations:
    1. National Medical Research Center for Obstetrics, Gynecology and Perinatology named after Academician V.I. Kulakov
    2. Center for Strategic Planning and Management of Medical and Biological Health Risks
    3. Russian Medical Academy of Postgraduate Education
    4. Central Research Institute of Epidemiology of the Federal Service on Customers’ Rights Protection and Human Well-being Surveillance
    5. I.M. Sechenov First Moscow State Medical University (Sechenov University)
    6. Ministry of Healthcare of Russian Federation
  • Issue: Vol 74, No 6 (2019)
  • Pages: 364-370
  • Section: OBSTETRICS AND GYNAECOLOGY: CURRENT ISSUES
  • URL: https://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/article/view/1198
  • DOI: https://doi.org/10.15690/vramn1198
  • Cite item
Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription or Fee Access

Abstract


The main direction of improving the quality of medical care for pregnant women, mothers and newborns is to improve the diagnosis and prevention of inflammatory infections, including healthcare-associated infections (HAI). A huge number of types of causative agents of opportunistic infections in women and newborns significantly complicates the etiological diagnosis and timely, adequate treatment at all stages of medical care. Recently, we have seen the emergence and spread of multi-resistant strains: bacteria from the ESKAPE-pathogens group (Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumanii, Pseudomonas aeroginosa, Enterobacter cloacae); as well as coagulase-negative staphylococci and yeasts, which easily realize their pathogenic potential for immunocompromised patients. The changed epidemiological situation requires the creation and functioning of a local system of surveillance of opportunistic infections in obstetrics and neonatology, primarily for the HAI, which will quickly monitor changes occurring in the etiological, intraspecific, strain structure of pathogens and respond to them in a timely manner. The evolution of technologies in microbiology allows introducing new approaches to the diagnosis, prevention and treatment of infections. Active use of modern methods of etiological diagnostics, development and application of innovative antimicrobial drugs in combination with coordinated work of physicians, microbiologists, clinical pharmacologists, epidemiologists and specialists in the field of molecular biology and bioinformatics is the key to the formation of new opportunities for epidemiological surveillance and prevention of infections in childbirth.


Full Text

Restricted Access

About the authors

Tatiana V. Priputnevich

National Medical Research Center for Obstetrics, Gynecology and Perinatology named after Academician V.I. Kulakov

Author for correspondence.
Email: priput1@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-4126-9730
SPIN-code: 8383-7023

Russian Federation, 117997, Moscow, Ac. Oparina street, 4

MD, PhD

Viktor V. Zubkov

National Medical Research Center for Obstetrics, Gynecology and Perinatology named after Academician V.I. Kulakov

Email: v_zubkov@oparina4.ru
ORCID iD: 0000-0001-8366-5208
SPIN-code: 5319-9297

Russian Federation, 117997, Moscow, Ac. Oparina street, 4

MD, PhD

Dmitry Yu. Trofimov

National Medical Research Center for Obstetrics, Gynecology and Perinatology named after Academician V.I. Kulakov

Email: d_trofimov@oparina4.ru
ORCID iD: 0000-0002-1569-8486
SPIN-code: 3067-2804

Russian Federation, 117997, Moscow, Ac. Oparina street, 4

PhD, Professor

Marina P. Shevyreva

Center for Strategic Planning and Management of Medical and Biological Health Risks

Email: shevirevamp@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-2567-7336
SPIN-code: 5434-8336

Russian Federation, 1-10, Pogodinskaya str., Moscow, 119121

MD, PhD, Professor

German G. Maryin

Russian Medical Academy of Postgraduate Education

Email: ger-marin@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-2179-8421
SPIN-code: 4205-1746

Russian Federation, 3-14, Solyanka str., Moscow, 109240

MD, PhD, Professor

Alexey V. Tutelyan

Central Research Institute of Epidemiology of the Federal Service on Customers’ Rights Protection and Human Well-being Surveillance

Email: bio-tav@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-2706-6689
SPIN-code: 8150-2230

Russian Federation, 3A, Novogireevskaya str., Moscow, 111123

MD, PhD, Professor

Vasiliy G. Akimkin

Central Research Institute of Epidemiology of the Federal Service on Customers’ Rights Protection and Human Well-being Surveillance

Email: vgakimkin@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-8139-0247
SPIN-code: 4038-7455

Russian Federation, 3A, Novogireevskaya str., Moscow, 111123

MD, PhD, Professor

Nikolay I. Briko

I.M. Sechenov First Moscow State Medical University (Sechenov University)

Email: nbrico@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-6446-2744
SPIN-code: 2992-6915

Russian Federation, 8-2, Trubetskaya street, Moscow, 119992

MD, PhD, Professor

Natalia A. Kostenko

Ministry of Healthcare of Russian Federation

Email: KostenkoNA@rosminzdrav.ru
ORCID iD: 0000-0001-6290-6586

Russian Federation, 3/25, Rakhmanovskii side street, Moscow, 127994

MD, PhD

Elena N. Baibarina

National Medical Research Center for Obstetrics, Gynecology and Perinatology named after Academician V.I. Kulakov; Ministry of Healthcare of Russian Federation

Email: baibarina@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-6262-3559
SPIN-code: 1989-0140

Russian Federation, 4, akademika Oparina street, Moscow, 117997; 3/25, Rakhmanovskii side street, Moscow, 127994

MD, PhD, Professor

Gennadiy T. Sukhikh

National Medical Research Center for Obstetrics, Gynecology and Perinatology named after Academician V.I. Kulakov

Email: g_sukhikh@oparina4.ru
ORCID iD: 0000-0002-7712-1260
SPIN-code: 9374-5710

Russian Federation, 4, akademika Oparina street, Moscow, 117997

MD, PhD, Professor

References

  1. Федеральный закон Российской Федерации № 323-ФЗ от 21 ноября 2011 г. «Об основах охраны здоровья граждан Российской Федерации». [Federal Law of Russian Federation № 323-F3 «Ob osnovakh okhrany zdorov’ya grazhdan Rossiiskoi Federatsii” dated 21 Nov 2011. (In Russ).] Доступно по: http://www.rosminzdrav.ru/documents/7025-federalnyy-zakon-323-fz-ot-21-noyabrya-2011-g. Ссылка активна на 20.08.2019.
  2. Приказ Министерства здравоохранения и социального развития РФ от 27 декабря 2011 г. № 1687н «О медицинских критериях рождения, форме документа о рождении и порядке ее выдачи». [Law of Ministry of Health of the Russian Federation № 1687n «O medicinskih kriteriyah rozhdeniya, forme dokumenta o rozhdenii i poryadke ee vydachi” dated 21 Dec 2011. (In Russ).] Доступно по: https://base.garant.ru/70113066/. Ссылка активна на 20.08.2019.
  3. Национальный проект «Здоровье» [интернет]. М., 2006. [National project “Zdorov’e”. Moscow; 2006. (In Russ).] Доступно по: https://www.webfoms.ru/page/page/view/6. Ссылка активна на 20.08.2019.
  4. Припутневич Т.В. Оптимизация микробиологической диагностики оппортунистических инфекций у беременных и новорожденных на основе протеометрических и молекулярно-генетических методов: Автореф. дис. ... д-ра мед. наук. ― М., 2014. ― 51 с. [Priputnevich TV. Optimizaciia mikrobiologicheskoi diagnostiki opportunisticheskih infekcii u beremennyh i novorozhdyonnyh na osnove proteometricheskih i molekulyarno-geneticheskih metodov. [dissertation abstract] Moscow; 2014. 51 р. (In Russ).] Доступно по: https://search.rsl.ru/ru/record/01005552671. Ссылка активна на 20.08.2019.
  5. Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Игонина Е.П., и др. Надзор за соблюдением санитарно-эпидемиологического законодательства при оказании медицинской помощи в целях обеспечения ее качества и безопасности // Вестник Росздравнадзора. ― 2016. ― №1. ― С. 74−78. [Popova AY, Ezhlova EB, Igonina EP, et al. Supervision over compliance with sanitary-epidemiological legislation in the provision of healthcare in order to ensure its quality and safety. Vestnik Roszdravnadzora. 2016;(1):74−78. (In Russ).]
  6. Найговзина Н.Б., Попова А.Ю., Бирюкова Е.Е., и др. Оптимизация системы мер борьбы и профилактики инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, в Российской Федерации // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. ― 2018. ― №1. ― С. 6−14. [Naygovzina NB, Popova AYu, Biryukova EE, et al. Optimization of the system of measures for control and prevention of healthcare-associated infections, in the Russian Federation. Èpidemiologiâ i infekcionnye bolezni. Aktual’nye voprosy. 2018;(1):6−14. (In Russ).]
  7. Припутневич Т.В., Ачкасова Е.Н., Чубаров В.В., Гордеев А.Б. Острые респираторные заболевания и грипп в современном акушерстве: эпидемиологические особенности и проблемы диагностики: обзор литературы // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. ― 2019. ― Т.18. ― №3. ― С. 89−95. [Priputnevich TV, Achkasova EN, Chubarov VV, Gordeev AB. Acute respiratory diseases and influenza in modern obstetrics: epidemiological features and diagnostic problems: literature review. Epidemiologia i vakcinoprofilaktika. 2019;18(3):89−95. (In Russ).] doi: 10.31631/2073-3046-2019-18-3-89-97.
  8. Припутневич Т.В., Любасовская Л.А., Дубоделов Д.В., и др. Эффективная профилактика и лечение ИСМП в родовспомогательных учреждениях Российской Федерации: нерешенные вопросы организации и контроля // Вестник Росздравнадзора. ― 2017. ― №4. ― С. 34−41. [Priputnevich T.V., Ljubasovskaya L.A., Dubodelov D.V., et al. Effective prevention and therapy of nosocomial infections in maternity units of the Russian Federation: unresolved issues of organization and control. Vestnik Roszdravnadzora. 2017;(4):34−41. (In Russ).]
  9. Wilkins CL, Lao JO. Identification of microorganisms by mass-spectrometry. Hoboken: John Wiley and Sons Inc.; 2005. 352 p.
  10. Припутневич Т.В., Мелкумян А.Р. Масс-спектрометрия ― новое слово в клинической микробиологии // Клиническая лабораторная диагностика. ― 2016. ― Т.61. ― №12. ― С. 842−848. [Priputnevich TV, Melkumyan AR. The mass-spectrometry as a new word in clinical microbiology. Klinicheskaya laboratornaya diagnostika. 2016;61(12):842−848. (In Russ).] doi: 10.18821/0869-2084-2016-61-12-842-848.
  11. Припутневич Т.В., Мелкумян А.Р., Любасовская Л.А., и др. Масс-спектрометрия в микробиологической практике научного центра акушерства, гинекологии и перинатологии // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. ― 2016. ― №1. ― С. 52−58. [Priputnevich TV, Melkumyan AR, Lyubasovskaya LA, et al. Mass-spectrometry in microbiological practice of scientific centre of obstetrics, gynecology and perinatology. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii. 2016;(1):52−58. (In Russ).]
  12. Motro Y, Moran-Gilad J. Next-generation sequencing applications in clinical bacteriology. Biomolecular Detection and Quantification. 2017; 14: 1-6. doi: 10.1016/j.bdq.2017.10.002
  13. Ребриков Д.В., Коростин Д.О., Шубина Е.С., Ильинский В.В. NGS: высокопроизводительное секвенирование. ― М.: БИНОМ. Лаборатория знаний; 2014. ― 235 c. [Rebrikov DV, Korostin DO, Shubina ES, Il’inskii VV. NGS: vysokoproizvoditel’noe sekvenirovanie. Moscow: BINOM. Laboratoriia znanii; 2014. 235 p. (In Russ).]
  14. Дубоделов Д.В., Любасовская Л.А., Шубина Е.С., и др. Генетические детерминанты резистентности к β-лактамным антибиотикам госпитальных штаммов Klebsiella pneumoniae, выделенных у новорожденных // Генетика. ― 2016. ― Т.52. ― №9. ― С. 1097−1102. [Dubodelov DV, Lubasovskaya LA, Shubina ES, et al. Genetic determinants of resistance of hospital-associated strains of Klebsiella pneumoniae to β-lactam antibiotics isolated in neonates. Russian Journal of Genetics. 2016;52(9):993−998. (In Russ).]
  15. ПЦР в реальном времени. 6-е изд. / Под ред. Д.В. Ребрикова. ― М.: БИНОМ. Лаборатория знаний; 2015. 223 с. [PCR v real’nom vremeni. 6th ed. Ed by DV Rebrikov. Moscow: BINOM. Laboratoriia znanii; 2015. 223 p. (In Russ).]
  16. Припутневич Т.В., Мелкумян А.Р., Бурменская О.В., и др. Использование методов MALDI-ToF масс-спектрометрии и количественной ПЦР для быстрой диагностики септических состояний // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. ― 2014. ― Т.16. ― №1. ― С. 4−9. [Priputnevitch TV, Melkumyan AR, Burmenskaya OV, et al. Use of MALDI-ToF mass-spectrometry and quantitative PCR for rapid diagnosis of sepsis. Clinical microbiology and antimicrobial chemotherapy. 2014;16(1):4−9. (In Russ).]
  17. Eldin C, Parola P, Raoult D. Limitations of diagnostic tests for bacterial infections. Med Mal Infect. 2019;49(2):98−101. doi: 10.1016/j.medmal.2018.12.004.
  18. Ильина Е.Н. Прямое МАЛДИ масс-спектрометрическое профилирование бактериальных белков для индикации и характеристики патогенов // Acta Naturae. ― 2009. ― Т.1. ― №1. ― С. 115−120. [Il’ina EN. Ionisation (MALDI) mass-spectrometry bacteria profiling for identifying and characterizing pathogens. Acta Naturae. 2009;1(1):115−120. (In Russ).]
  19. El-Bouri K, Johnston S, Rees E, et al. Comparison of bacterial identification by MALDI-TOF mass spectrometry and conventional diagnostic microbiology methods: agreement, speed and cost implications. Br J Biomed Sci. 2012;69(2):47−55. doi: 10.1080/09674845.2012.12002436.
  20. Neppelenbroek KH, Seó RS, Urban VM, et al. Identification of Candida species in the clinical laboratory: a review of conventional, commercial, and molecular techniques. Oral Dis. 2014;20(4):329−344. doi: 10.1111/odi.12123.
  21. Муравьева В.В., Припутневич Т.В., Завьялова М.Г., и др. Сравнительная оценка видовой идентификации вагинальных изолятов дрожжевых грибов методом MALDI-ToF MS и традиционными (биохимическим и фенотипическим) методами // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. ― 2014. ― Т.16. ― №1. ― С. 10−17. [Muravyova VV, Priputnevitch TV, Zavyalova MG, et al. Comparative assessment of species identification of vaginal yeast isolates using MALDI-TOF MS and conventional (biochemical and phenotypic) methods. Clinical microbiology and antimicrobial chemotherapy. 2014;16(1):10−17. (In Russ).]
  22. Muravieva VV, Gordeev AB, Lyubasovskaya LA, et al. Comparative analysis of yeast species identification using phenotypic methods and real-time PCR. Medical Mycology. Volume 56, Issue suppl_2, 1 June 2018, Pages S68, https://doi.org/10.1093/mmy/myy036
  23. Припутневич Т.В., Любасовская Л.А., Дубоделов Д.В., и др. Результаты пилотного проекта по изучению распределения и интенсивности циркуляции штаммов возбудителей (в т.ч. резистентных) инфекционных заболеваний среди беременных, родильниц и новорожденных в регионах Российской Федерации // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. ― 2018. ― Т.20. ― №S1. ― С. 35−36. [Priputnevich TV, Lyubasovskaya LA, Dubodelov DV., et al. Rezul’taty pilotnogo proekta po izucheniyu raspredeleniya i intensivnosti cirkulyacii shtammov vozbuditelei (v t.ch. rezistentnyh) infekcionnyh zabolevanij sredi beremennyh, rodil’nic i novorozhdennyh v regionah Rossiiskoi Federacii. Clinical microbiology and antimicrobial chemotherapy. 2018;20(S1):35−36. (In Russ).]
  24. Припутневич Т.В. Результаты пилотного проекта «Изучение распределения и интенсивности циркуляции штаммов возбудителей (в т.ч. резистентных) инфекционных заболеваний среди беременных, родильниц и новорожденных в регионах Российской Федерации» // Акушерство и гинекология. ― 2018. ― №S12/1. ― С. 5−36. [Priputnevich TV. Rezul’taty pilotnogo proekta “Izuchenie raspredeleniya i intensivnosti cirkulyacii shtammov vozbuditelei (v t.ch. rezistentnyh) infekcionnyh zabolevanii sredi beremennyh, rodil’nic i novorozhdennyh v regionah Rossiiskoi Federacii”. Obstetrics and Gynecology. 2018;(S12/1):5−36. (In Russ).]
  25. Патент РФ на изобретение RU № 2629322. Припутневич Т.В., Любасовская Л.А., Гордеев А.Б., и др. Способ выявления возбудителей нозокомиальных оппортунистических инфекций и маркеров их резистентности к бета-лактамным антибиотикам и гликопептидам у женщин репродуктивного возраста и новорожденных детей для оптимизации антибактериальной терапии. [Patent RUS № 2629322. Priputnevich TV, Lyubasovskaya LA, Gordeev AB, et al. Sposob vyyavleniia vozbuditelei nozokomial’nyh opportunisticheskih infekcii i markerov ih rezistentnosti k beta-laktamnym antibiotikam i glikopeptidam u zhenshchin reproduktivnogo vozrasta i novorozhdennyh detei dlia optimizacii antibakterial’noi terapii. (In Russ).] Доступно по: https://yandex.ru/patents/doc/RU2629322C1_20170828. Ссылка активна на 20.08.2019.
  26. Патент РФ на изобретение RU № 2638453. Припутневич Т.В., Любасовская Л.А., Гордеев А.Б., и др. Способ выявления и оценки уровня патогенности возбудителей оппортунистических инфекций у женщин репродуктивного возраста и новорожденных детей для прогнозирования течения и развития осложнений инфекционных заболеваний. [Patent RUS № 2638453. Priputnevich TV, Lyubasovskaya LA, Gordeev AB, et al. Sposob vyiavleniia i ocenki urovnia patogennosti vozbuditelei opportunisticheskih infekcii u zhenshchin reproduktivnogo vozrasta i novorozhdennyh detei dlia prognozirovaniia techeniia i razvitiia oslozhnenii infekcionnyh zabolevanii. (In Russ).] Доступно по: https://yandex.ru/patents/doc/RU2638453C1_20171213. Ссылка активна на 20.08.2019.
  27. Патент РФ на изобретение RU № 2641258. Припутневич Т.В., Мелкумян А.Р., Любасовская Л.А., и др. Пробиотический штамм Lactobacillus gasseri и его композиция с лактоферрином для профилактики диареи, некротизирующего энтероколита и сепсиса, вызываемых штаммами E. coli у преждевременно рожденных детей. [Patent RUS № 2641258. Priputnevich TV, Melkumyan AR, Lyubasovskaya LA, et al. Probioticheskii shtamm Lactobacillus gasseri i ego kompoziciia s laktoferrinom dlia profilaktiki diarei, nekrotiziruyushchego enterokolita i sepsisa, vyzyvaemyh shtammami E. coli u prezhdevremenno rozhdennyh detei. (In Russ).] Доступно по: https://yandex.ru/patents/doc/RU2641258C1_20180116. Ссылка активна на 20.08.2019.

Supplementary files

There are no supplementary files to display.

Statistics

Views

Abstract - 464

PDF (Russian) - 3

Cited-By


Article Metrics

Metrics Loading ...

Metrics powered by PLOS ALM

PlumX

Dimensions



Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies