<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Annals of the Russian academy of medical sciences</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Annals of the Russian academy of medical sciences</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Вестник Российской академии медицинских наук</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">0869-6047</issn><issn publication-format="electronic">2414-3545</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">"Paediatrician" Publishers LLC</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">472</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15690/vramn.v69.i3-4.999</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>SHORT MESSAGES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">THE AIRWAYS MICROBIAL COMMUNITY COMPOSITION IN HEALTHY INDIVIDUALS AND BRONCHIAL ASTHMA PATIENTS</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>СОСТАВ СООБЩЕСТВА МИКРООРГАНИЗМОВ В ДЫХАТЕЛЬНЫХ ПУТЯХ У ЗДОРОВЫХ ЛИЦ И БОЛЬНЫХ БРОНХИАЛЬНОЙ АСТМОЙ</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Fedosenko</surname><given-names>S. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Федосенко</surname><given-names>С. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="ru"><p>кандидат медицинских наук, докторант кафедры госпитальной терапии с курсом физической реабилитации и спортивной медицины ГБОУ ВПО «СибГМУ» МЗ РФ  Адрес: 634050, Томск, Московский тракт, д. 2, тел.: (3822) 51-49-67</p></bio><email>s-fedosenko@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Ogorodova</surname><given-names>L. M.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Огородова</surname><given-names>Л. М.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="ru"><p>доктор медицинских наук, профессор, член-корреспондент РАМН, заведующая кафедрой факультетской педиатрии с курсом детских болезней лечебного факультета ГБОУ ВПО «СибГМУ» МЗ РФ, заместитель министра науки и образования Российской Федерации  Адрес: 634050, Томск, Московский тракт, д. 2, тел.: (3822) 51-49-67</p></bio><email>lm-ogorodova@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Karnaushkina</surname><given-names>M. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Карнаушкина</surname><given-names>М. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="ru"><p>кандидат медицинских наук, ассистент кафедры пульмонологии ФПДО ГБОУ ВПО «МГМСУ им. А.И. Евдокимова» МЗ РФ  Адрес: 127473, Москва, ул. Делегатская, д. 20, стр. 1, тел.: (495) 681-57-69</p></bio><email>kar3745@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kulikov</surname><given-names>E. S.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Куликов</surname><given-names>Е. С.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="ru"><p>кандидат медицинских наук, докторант кафедры госпитальной терапии с курсом физической реабилитации и спортивной медицины ГБОУ ВПО «СибГМУ» МЗ РФ  Адрес: 634050, Томск, Московский тракт, д. 2, тел.: (3822) 51-49-67</p></bio><email>evgeny.s.kulikov@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Deev</surname><given-names>I. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Деев</surname><given-names>И. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="ru"><p>доктор медицинских наук, профессор кафедры факультетской педиатрии с курсом детских болезней лечебного факультета ГБОУ ВПО «СибГМУ» МЗ РФ, Первый заместитель начальника Департамента здравоохранения Томской области  Адрес: 634050, Томск, Московский тракт, д. 2, тел.: (3822) 51-49-67</p></bio><email>ivandeyev@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kirillova</surname><given-names>N. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Кириллова</surname><given-names>Н. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="ru"><p>кандидат медицинских наук, ассистент кафедры общей врачебной практики и поликлинической терапии ФПК и ППС ГБОУ ВПО «СибГМУ» МЗ РФ  Адрес: 634050, Томск, Московский тракт, д. 2, тел.: (3822) 51-49-67</p></bio><email>kirillova.natalya@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Siberian State Medical University, Tomsk, Russian Federation</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Сибирский государственный медицинский университет, Томск, Российская Федерация</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">A.I. Evdokimov Moscow State University of Medicine and Dentistry, Moscow, Russian Federation</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Московский государственный медико-стоматологический университет им. А.И. Евдокимова, Российская Федерация</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2014-08-21" publication-format="electronic"><day>21</day><month>08</month><year>2014</year></pub-date><volume>69</volume><issue>3-4</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru">Вестник Российской академии медицинских наук</issue-title><fpage>71</fpage><lpage>76</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2015-08-21"><day>21</day><month>08</month><year>2015</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2015-08-21"><day>21</day><month>08</month><year>2015</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2015, "Paediatrician" Publishers LLC</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2015, Издательство "Педиатръ"</copyright-statement><copyright-year>2015</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">"Paediatrician" Publishers LLC</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Издательство "Педиатръ"</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" start_date="2016-02-21"/></permissions><self-uri xlink:href="https://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/article/view/472">https://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/article/view/472</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>This review summarizes the results of studies on the composition of microbial communities in the airways of healthy individuals and patients with asthma. Modern molecular genetic technology of the microbial identification, which are based on a sequence determination of encoding proteins genes conserved regions. These regions form the 16s-subunit ribosomal RNA in microorganisms of different species. These genes are detected by sequencing markers characteristic of individual microorganisms and their phylogenetic groups, and allow to perform a deep analysis of the microbiota in healthy volunteers and patients with chronic bronchoobstructive diseases. So, apparently healthy human bronchial tree is characterized by low bacterial contamination (most typical representatives here are the genera Pseudomonas, Streptococcus, Prevotella, Fusobacteria and Veilonella, much less potentially pathogenic Haemophilus and Neisseria are represented). In bronchial asthma patients the lower respiratory tract microbiota undergoes a qualitative transformation: as compared to healthy individuals the number of Proteobacteria increases and the number of Bacteroidetes decreases. Severe asthma in children is associated with significant respiratory tract Staphylococcus spp. insemination. Association between the asthma developing higher risk in young children and organisms such as Haemophilus, Moraxella and Neisseria spp. It is of considerable interest to determine the role of the microbiome in the development of human diseases of the bronchopulmonary system, and to understand the impact of the microbes communities as a course of disease and the important factor for the development of resistance to therapy.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>В обзоре обобщены результаты исследований по изучению состава сообщества микроорганизмов в дыхательных путях здоровых лиц и пациентов с бронхиальной астмой. Современные технологии молекулярно-генетической идентификации микроорганизмов основаны на определении последовательности консервативных участков генов, кодирующих белки, которые формируют 16s-субъединицу рибосомальной рибонуклеиновой кислоты микроорганизмов различных видов. Данные гены имеют выявляемые секвенированием маркеры, характерные для отдельных микроорганизмов и их филогенетических групп, и позволяют выполнить глубокий анализ микробиома как у здоровых добровольцев, так и у больных хроническими бронхообструктивными заболеваниями. Так, у практически здорового человека бронхиальное дерево характеризуется низкой бактериальной обсемененностью (наиболее типичными являются представители родов Pseudomonas, Streptococcus, Prevotella, Fusobacteria и Veilonella, значительно реже представлены потенциально патогенные Haemophilus и Neisseria). У больных брон-хиальной астмой микробиота нижних дыхательных путей подвергается качественной трансформации: по сравнению со здоровыми инди-видуумами количество Proteobacteria увеличивается, а Bacteroidetes — уменьшается. Тяжелая бронхиальная астма у детей ассоциирована со значимой обсемененностью дыхательных путей Staphylococcus spp. Также обнаружена ассоциация более высокого риска развития аст-мы у детей раннего возраста и такими микроорганизмами, как Haemophilus, Moraxella и Neisseria spp. Полученные данные представляют значительный интерес как для определения роли микробиома в развитии заболеваний бронхолегочной системы человека, так и для понимания влияния микробиотических сообществ на особенности течения болезни и формирование резистентности к терапии. </p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>community of microorganisms</kwd><kwd>respiratory microbiome</kwd><kwd>bronchial asthma</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>сообщество микроорганизмов</kwd><kwd>респираторный микробиом</kwd><kwd>бронхиальная астма</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>1. Hilty M., Burke C., Pedro H., Cardenas P., Bush A., Bossley C., Davies J., Ervine A., Poulter L., Pachter L., Moffatt M.F., Cookson W.O. Disordered microbial communities in asthmatic airways. PLoS One. 2010; 5: 8578.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>2. Abt M.C., Artis D. The intestinal microbiota in health and disease: the influence of microbial products on immune cell homeostasis. Curr. Opin. Gastroenterol. 2009; 25: 496–502.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>3. Staley J.T., Konopka A. Measurement of in situ activities of nonphotosynthetic microorganisms in aquatic and terrestrial habitats. Ann. Rev. Microbiol. 1985; 39: 321–346.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>4. Charlson E.S., Bittinger K., Haas A.R., Fitzgerald A.S., Frank I., Yadav A., Bushman F.D., Collman R.G. Topographical continuity of bacterial populations in the healthy human respiratory tract. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2011; 184 (8): 957–963. Doi: 10.1164/rccm.201104-0655OC</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>5. Sehti S., Murphy T.F. Infection in the pathogenesis and course of chronic obstructive Pulmonary Disease. N. Engl. J. Med. 2008; 359: 2355–2365.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>6. Huang Y.J., Charlson E.S., Collman R.G., Colombini-Hatch S., Martinez F.D., Senior R.M. The role of the lung microbiome in health and disease. A national heart, lung, and blood institute workshop report. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2013; 187 (12): 1382–1387.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>7. Gern J.E., Lemanske R.F., Jr. Infectious triggers of pediatric asthma. Pediatr. Clin. North Am. 2003; 50 (3): 555–575.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>8. Sehti S., Evans N., Grant B.J.B., Murphy T.F. N. New strains of bacteria and exacerbations of chronic obstructive pulmonary disease. Engl. J. Med. 2002; 347: 465–471.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>9. Johnston S.L. Viruses and asthma. Allergy. 1998; 53 (10): 922–932.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>10. Busse W.W. Respiratory infections: their role in airway responsiveness and the pathogenesis of asthma. J. Allergy Clin. Immunol. 1990; 85 (4): 671–683.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>11. Чучалин А.Г., Авдеев С.Н., Архипов В.В., Бабак С.Л. Рациональная фармакотерапия заболеваний органов дыхания: Рук. для практикующих врачей. М.: Литтерра. 2004. 874 с.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>12. Arocha-Sandoval F., Parra-Quevedo K. Oropharyngeal bacteria in asthmatic patients in the city of Maracaibo, Venezuela. Invest. Clin. 2002; 43 (3): 145–155.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>13. Aas J.A., Paster B.J., Stokes L.N., Olsen I., Dewhirst F.E. Defining the normal bacterial flora of the oral cavity. J. Clin. Microbiol. 2005; 43: 5721–5732.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>14. Bisgaard H., Hermansen M.N., Buchvald F., Loland L., Halkjaer L.B. Childhood asthma after bacterial colonization of the airway in neonates. N. Engl. J. Med. 2007; 357: 1487–1495.</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>15. Sutherland E.R., Martin R.J. Asthma and atypical bacterial infection. Chest. 2007; 132: 1962–1966.</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>16. Morens D.M., Taubenberger J.K., Fauci A.S. Predominant role of bacterial pneumonia as a cause of death in pandemic influenza: implications for pandemic influenza preparedness. J. Infect. Dis. 2008; 198: 962–970.</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>17. Hussell T., Wissinger E., Goulding J. Bacterial complications during pandemic influenza infection. Future Microbiol. 2009; 4: 269–272.</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>18. Wark P., Tooze M., Powell H., Parsons K. Viral and bacterial infection in acute asthma &amp; chronic obstructive pulmonary disease increases the risk of readmission. Respirology. 2013; doi: 10.1111/ resp.12099.</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>19. Didierlaurent A., Goulding J., Hussell T. The impact of successive infections on the lung microenvironment. Immunology. 2007; 122: 457–465.</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>20. Blasi F., Johnston S.L. The role of antibiotics in asthma. Int. J. Antimicrob. Agents. 2007; 29: 485–493.</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>21. Donnelly D., Critchlow A., Everard M.L. Outcomes in children treated for persistent bacterial bronchitis. Thorax. 2007; 62: 80–84.</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>22. Specjalski K. Role of Chlamydia pneumoniae and Mycoplasma pneumoniae infections in the course of asthma. Pneumonol. Alergol. Pol. 2010; 78 (4): 284–295.</mixed-citation></ref><ref id="B23"><label>23.</label><mixed-citation>23. Han M.K., Huang Y.J., LiPuma J.J. Significance of the microbiome in obstructive lung disease. Thorax. 2012; 67 (5): 456–463.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
