Annals of the Russian academy of medical sciencesAnnals of the Russian academy of medical sciencesВестник Российской академии медицинских наук0869-60472414-3545"Paediatrician" Publishers LLC211810.15690/vramn2118INFECTIOUS DISEASES: CURRENT ISSUESАКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ ИНФЕКЦИОННЫХ БОЛЕЗНЕЙReview ArticleCOVID-19 in Russia: Evolution of Views on the Pandemic. Report ICOVID-19 в России: эволюция взглядов на пандемию (часть 1)https://orcid.org/0000-0002-3625-42787223-9834StarodubovVladimir I.СтародубовВладимир Иванович
Russian Federation

MD, PhD, Professor, Academician of the RAS

д.м.н., профессор, академик РАН

starodubov@mednet.ruhttps://orcid.org/0000-0002-0210-45705940-7554BeregovykhValery V.БереговыхВалерий Васильевич
Russian Federation

PhD of Technical Sciences, Professor, Academician of the RAS

д.т.н., профессор, академик РАН

beregovykh@ramn.ruhttps://orcid.org/0000-0003-4228-90444038-7455AkimkinVasily G.АкимкинВасилий Геннадьевич
Russian Federation

MD, PhD, Professor, Academician of the RAS

д.м.н., профессор, академик РАН

vgakimkin@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0002-6686-90118375-2270SemenenkoTatiana A.СемененкоТатьяна Анатольевна
Russian Federation

MD, PhD, Professor

д.м.н., профессор

meddy@inbox.ruhttps://orcid.org/0000-0002-1322-01558840-5814UglevaSvetlana V.УглеваСветлана Викторовна
Russian Federation

MD, PhD, Professor

д.м.н., профессор

uglevas@bk.ruhttps://orcid.org/0000-0002-5999-21501645-5524AvdeevSergey N.АвдеевСергей Николаевич
Russian Federation

MD, PhD, Professor, Corresponding Member of the RAS

д.м.н., профессор, член-корреспондент РАН

serg_avdeev@list.ruhttps://orcid.org/0000-0003-3385-26326269-7990ZykovKirill A.ЗыковКирилл Алексеевич
Russian Federation

MD, PhD, Professor

д.м.н., профессор

kiriliaz@inbox.ruhttps://orcid.org/0000-0003-4871-23419733-2755TrofimovaTat’yana N.ТрофимоваТатьяна Николаевна
Russian Federation

MD, PhD, Professor

д.м.н., профессор

ttrofimova@sogaz-clinic.ruhttps://orcid.org/0000-0002-4165-804X4168-6400PogosovaNana V.ПогосоваНана Вачиковна
Russian Federation

MD, PhD, Professor

д.м.н., профессор

nanapogosova@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0001-7166-02908770-6877PerekhodovSergey N.ПереходовСергей Николаевич
Russian Federation

MD, PhD, Associate Professor

д.м.н., доцент

persenmd@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-0616-97771372-7623KuzinStanislav N.КузинСтанислав Николаевич
Russian Federation

MD, PhD, Professor

д.м.н., профессор

kuzin@cmd.suhttps://orcid.org/0000-0003-4737-941X7156-2948YacyshinaSvetlana В.ЯцышинаСветлана Борисовна
Russian Federation

PhD in Biology, Senior Research Associate

к.б.н., с.н.с.

svetlana.yatsyshina@pcr.mshttps://orcid.org/0000-0002-3503-23669852-8292PetrovVadim V.ПетровВадим Викторович
Russian Federation

руководитель научной группы разработки новых молекулярно-биологических технологий

petrov@pcr.mshttps://orcid.org/0000-0001-5524-02969082-5749KhafizovKamil F.ХафизовКамиль Фаридович
Russian Federation

PhD in Biology

к.б.н.

khafizov@cmd.suhttps://orcid.org/0000-0003-3093-57314860-7909DubodelovDmitry V.ДубоделовДмитрий Васильевич
Russian Federation

MD, PhD, Senior Research Associate

к.м.н., с.н.с.

dubodelov@cmd.suhttps://orcid.org/0000-0002-0121-521X9726-9380GasanovGasan A.ГасановГасан Алиевич
Russian Federation

PhD Student

аспирант

gasanovgt500@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0001-7524-30802345-4460SvanadzeNino Kh.СванадзеНино Хвичаевна
Russian Federation

MD

врач-эпидемиолог

svanadze@cmd.suhttps://orcid.org/0000-0001-7970-74957854-7358CherkashinaAnna S.ЧеркашинаАнна Сергеевна
Russian Federation

PhD in Chemistry

к.х.н.

cherkashina@pcr.mshttps://orcid.org/0000-0002-8813-59323156-7024SinitsynEvgeny A.СиницынЕвгений Александрович
Russian Federation

MD

главный врач

sinymlad@list.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9277-22915267-9598RvachevaAnna V.РвачеваАнна Валерьевна
Russian Federation

MD, PhD

к.м.н.

arvatcheva@mail.ruSergeevaNatal’ya V.СергееваНаталья Васильевна
Russian Federation
tkb_3@mail.ruPolosovaTat’yana A.ПолосоваТатьяна Александровна
Russian Federation

MD, PhD, Associate Professor

к.м.н., доцент

f-therapy@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9577-4815ZykovaAlexandra A.ЗыковаАлександра Алексеевна
Russian Federation

MD, PhD

к.м.н.

zykova.aal@medsigroup.ruhttps://orcid.org/0000-0001-6622-47349418-3070ZeleninDmitrii A.ЗеленинДмитрий Александрович
Russian Federation

MD, PhD

к.м.н.

d_zelenin@inbox.ruhttps://orcid.org/0000-0003-4678-5459GorbenkoMihail Yu.ГорбенкоМихаил Юрьевич
Russian Federation

MD

кардиохирург

gorbenko68gkb@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0001-9548-64268161-4082RodyukovaIrina S.РодюковаИрина Сергеевна
Russian Federation

MD, PhD, Associate Professor

к.м.н., доцент

irina.rodyukova@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0001-5891-34173971-4607ChausNikolay I.ЧаусНиколай Иванович
Russian Federation

MD, PhD, Associate Professor

к.м.н., доцент

nikchaus@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0001-6053-46513059-5317SnitsarArtem V.СницарьАртем Владимирович
Russian Federation
snitsarav@yandex.ruRussian Research Institute of HealthЦентральный научно-исследовательский институт организации и информатизации здравоохраненияI.M. Sechenov First Moscow State Medical University (Sechenov University)Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова (Сеченовский Университет)Central Research Institute of EpidemiologyЦентральный научно-исследовательский институт эпидемиологииNational Research Center of Epidemiology and Microbiology named after Honorary Academician N.F. GamaleyaНациональный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. ГамалеиPulmonology Scientific Research InstituteНаучно-исследовательский институт пульмонологииА.I. Yevdokimov Moscow State University of Medicine and DentistryМосковский государственный медико-стоматологический университет им. А.И. ЕвдокимоваPavlov First St. Petersburg State Medical UniversityПервый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. ПавловаNational Medical Research Center of Cardiology named after Academician E.I. ChazovНациональный медицинский исследовательский центр кардиологии имени академика Е.И. ЧазоваProfessor G.A. Zakharyin Tuberculosis Clinical Hospital No. 3Туберкулезная клиническая больница № 3 имени профессора Г.А. ЗахарьинаCity Clinical Hospital named after V.P. DemihovГородская клиническая больница имени В.П. ДемиховаPirogov Russian National Research Medical University (Pirogov Medical University)Российский национальный исследовательский институт имени Н.И. ПироговаRussian Medical Academy of Continuous Professional EducationРоссийская медицинская академия непрерывного профессионального образования310720227731992071606202226062022Copyright ©; 2022, "Paediatrician" Publishers LLCCopyright ©; 2022, Издательство "Педиатръ"2022"Paediatrician" Publishers LLCИздательство "Педиатръ"https://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/about/submissionshttps://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/article/view/2118

Over the two years of the novel coronavirus infection (COVID-19) pandemic, there has been an evolution of views in various fields of medicine, which has led to a powerful development of scientific research in the field of epidemiology, clinic, diagnosis and therapy of COVID-19. The article highlights the evolution of views and approaches to the study of the epidemiology and radiology of COVID-19. The data of molecular genetic studies are shown, which are the most important component of epidemiological surveillance. The study of the manifestations of the COVID-19 epidemic process made it possible to distinguish two stages in the development of the epidemiological situation in the Russian Federation. At the first stage of the epidemic, two rises in the incidence rate of the population were recorded, regulated by social and natural factors. The second stage of the epidemic was due to a change in the biological properties of the SARS-CoV-2 virus, followed by a change in the prevailing genovariants (Alpha, Delta and Omicron). At the second stage of the epidemic, three rises in the incidence of the population were recorded. The general principles for the use of radiodiagnosis methods, which are used primarily to detect lung damage in COVID-19, are given. With the accumulation of experience, a natural change in ideas about the algorithms for the use of visualization technologies has occurred.

За два года пандемии новой коронавирусной инфекции (COVID-19) произошла эволюция взглядов в различных областях медицины, что привело к мощному развитию научных исследований в области эпидемиологии, клиники, диагностики и терапии COVID-19. В статье освещены вопросы эволюции взглядов и подходов к изучению эпидемиологии и лучевой диагностики COVID-19. Показаны данные молекулярно-генетических исследований, которые являются важнейшим компонентом эпидемиологического надзора. Изучение проявлений эпидемического процесса COVID-19 позволило выделить два этапа развития эпидемиологической ситуации на территории Российской Федерации. На первом этапе эпидемии были зафиксированы два подъема уровня заболеваемости населения, регулируемых социальными и природными факторами. Второй этап эпидемии был обусловлен изменением биологических свойств вируса SARS-CoV-2 с последующей сменой превалирующих геновариантов (Alpha, Delta и Omicron). На втором этапе эпидемии были зафиксированы три подъема уровня заболеваемости населения. Даны общие принципы применения методов лучевой диагностики, которые используют в первую очередь для выявления поражения легких при COVID-19. По мере накопления опыта произошло закономерное изменение представлений об алгоритмах применения визуализационных технологий.

epidemiologySARS-CoV-2radiographysequence analysisэпидемиологияSARS-CoV-2секвенированиелучевая диагностикаCOVID-19: научно-практические аспекты борьбы с пандемией в Российской Федерации / под ред. А.Ю. Поповой. — Саратов: Амирит, 2021. — 608 с. [COVID-19: nauchno-prakticheskie aspekty bor’by s pandemiej v Rossijskoj Federacii / pod red. A. Yu. Popovoj. Saratov: Amirit; 2021. 608 s. (In Russ.)]Акимкин В.Г., Кузин С.Н., Семененко Т.А., и др. Характеристика эпидемиологической ситуации по COVID-19 в Российской Федерации в 2020 г. // Вестник РАМН. — 2021. — Т. 76. — № 4. — С. 412–422. [Akimkin VG, Kuzin SN, Semenenko TA, et al. Characteristics of the COVID-19 Epidemiological Situation in the Russian Federation in 2020. Annals of the Russian Academy of Medical Sciences. 2021;76(4):412–422. (In Russ.)] doi: https://doi.org/10.15690/vramn1505Пшеничная Н.Ю., Лизинфельд И.А, Журавлев Г.Ю., и др. Эпидемический процесс COVID-19 в Российской Федерации: промежуточные итоги. Сообщение 1 // Инфекционные болезни. — 2020. — Т. 18. — № 3. — С. 7–14. [Pshenichnaya NYu, Lizinfeld IA, Zhuravlev GYu, et al. Epidemic process of COVID-19 in the Russian Federation: interim results. 1th report. Infectious Diseases. 2020;18(3):7–14. (In Russ.)] doi: https://doi.org/10.20953/1729-9225-2020-3-7-14Кутырев В.В., Попова А.Ю., Смоленский В.Ю., и др. Эпидемиологические особенности новой коронавирусной инфекции (COVID-19). Сообщение 1: Модели реализации профилактических и противоэпидемических мероприятий // Проблемы особо опасных инфекций. — 2020. — № 1. — С. 6–13. [Kutyrev VV, Popova AYu, Smolensky VYu, et al. Epidemiological Features of New Coronavirus Infection (COVID-19). Communication 1: Modes of Implementation of Preventive and Anti-Epidemic Measures. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2020;1:6–13. (In Russ.)] doi: https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-1-6-13Акимкин В.Г., Кузин С.Н., Колосовская Е.Н., и др. Характеристика эпидемиологической ситуации по COVID-19 в Санкт-Петербурге // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. — 2021. — Т. 98. — № 5. — С. 497–511. [Akimkin VG, Kuzin SN, Kolosovskaya EN, et al. Assessment of the COVID-19 epidemiological situation in St. Petersburg. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii, i Immunobiologii. 2021;98(5):497–511. (In Russ.)] doi: https://doi.org/10.36233/0372-9311-154Задорожный А.В., Пшеничная Н.Ю., Углева С.В., и др. Сравнительный анализ заболеваемости COVID-19 среди населения Москвы и в организованных коллективах в учреждениях общественного проживания в период пандемии // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. — 2021. — № 2. — С. 36–41. [Zadoroshnyi AV, Pshenichnaya NYu, Ugleva SV, et al. Comparative analysis of the incidence of COVID-19 among the population of Moscow and the organized groups of dormitories during the pandemic. Epidemiology and Infectious Diseases. Current items. 2021;2:36–41. (In Russ.)] doi: https://doi.org/10.18565/epidem.2021.11.2.36-41Пшеничная Н.Ю., Лизинфельд И.А, Журавлев Г.Ю., и др. Эпидемический процесс COVID-19 в Российский Федерации: промежуточные итоги. Сообщение 2 // Инфекционные болезни. — 2021. — № 1. — С. 10–15. [Pshenichnaya NYu, Lizinfeld IA, Zhuravlev GYu, et al. Epidemic process of COVID-19 in the Russian Federation: interim results. 2nd report. Infectious Diseases. 2021;19(1):10–15. (In Russ.)] doi: https://doi.org/ 10.20953/1729-9225-2021-1-10-15Акимкин В.Г., Кузин С.Н., Семененко Т.А., и др. Закономерности эпидемического распространения SARS-CoV-2 в условиях мегаполиса // Вопросы вирусологии. — 2020. — Т. 65. — № 4. — С. 203–211. [Akimkin VG, Kuzin SN, Semenenko TA, et al. Patterns of the SARS-CoV-2 epidemic spread in a megacity. Problems of Virology. 2020;65(4):203–211. (In Russ.)] doi: https://doi.org/10.36233/0507-4088-2020-65-4-203-211Акимкин В.Г., Кузин С.Н., Семененко Т.А., и др. Гендерно-возрастная характеристика пациентов с COVID-19 на разных этапах эпидемии в Москве // Проблемы особо опасных инфекций. — 2020. — № 3. — С. 27–35. [Akimkin VG, Kuzin SN, Semenenko TA, et al. Gender-Age Distribution of Patients with COVID-19 at Different Stages of Epidemic in Moscow. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2020;3:27–35. (In Russ.)] doi: https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-3-27-35Kaptelova VV, Bukharina AY, Shipulina OY, et al. Case report: change of dominant strain during dual SARS-CoV-2 infection. BMC Infect Dis. 2021;21(1):959. doi: https://doi.org/10.1186/s12879-021-06664-wБорисова Н.И., Котов И.А., Колесников А.А., и др. Мониторинг распространения вариантов SARS-CoV-2 (Coronaviridae: Coronavirinae: Betacoronavirus; Sarbecovirus) на территории Московского региона с помощью таргетного высокопроизводительного секвенирования // Вопросы вирусологии. — 2021. — № 4. — С. 269–278. [Borisova NI, Kotov IA, Kolesnikov AA, et al. Monitoring the spread of the SARS-CoV-2 (Coronaviridae: Coronavirinae: Betacoronavirus; Sarbecovirus) variants in the Moscow region using targeted high-throughput sequencing. Problems of Virology. 2021;66(4):269–278. (In Russ.)] doi: https://doi.org/10.36233/0507-4088-72Российская платформа агрегации информации о геномах вирусов VGARus (Virus Genome Aggregator of Russia). Available from: https://genome.crie.ru/app/index (accessed: 17.05.2022).Deng L, Khan A, Zhou W, et al. Follow-up study of clinical and chest CT scans in confirmed COVID-19 patients. Radiol Infect Dis. 2020;7(3):106–113. doi: https://doi.org/10.1016/j.jrid.2020.07.002Li W, Hu L, Huang J, et al. Outcome of Pulmonary Spherical Ground-glass Opacities on Ct in Patients with Coronavirus Disease 2019 (COVID-19): A Retrospective Analysis. Research Square. doi: https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-30665/v1Wei J, Yang H, Lei P, et al. Analysis of thin-section CT in patients with coronavirus disease (COVID-19) after hospital discharge. J Xray Sci Technol. 2020;28(3):383–389. doi: https://doi.org/10.3233/XST-200685Antonio GE, Wong KT, Hui DS, et al. Thin-section CT in patients with severe acute respiratory syndrome following hospital discharge: preliminary experience. Radiology. 2003;228(3):810–815. doi: https://doi.org/10.1148/radiol.2283030726Francone M, Iafrate F, Masci GM, et al. Chest CT score in COVID-19 patients: correlation with disease severity and short-term prognosis. Eur Radiol. 2020;30(12):6808–6817. doi: https://doi.org/10.1007/s00330-020-07033-yYu M, Liu Y, Xu D, et al. Prediction of the Development of Pulmonary Fibrosis Using Serial Thin-Section CT and Clinical Features in Patients Discharged after Treatment for COVID-19 Pneumonia. Korean J Radiol. 2020;21(6):746–755. doi: https://doi.org/10.3348/kjr.2020.0215Винокуров А.С., Зюзя Ю.Р., Юдин А.Л. Эволюция изменений в легких по данным КТ при динамическом наблюдении пациентов с COVID-19 в ранние сроки // Лучевая диагностика и терапия. — 2020. — Т. 11. — № 2. — С. 76–88. [Vinokurov AS, Zyuzya YuR, Yudin AL. Evolution of follow up ct signs in patients with COVID-19 in early stage. Diagnostic Radiology and Radiotherapy. 2020;11(2):76–88. (In Russ.)] doi: http://dx.doi.org/10.22328/2079-5343-2020-11-2-76-88Михеев А.В., Афтаева Е.В., Казакова С.С., и др. Спонтанный пневмоторакс как осложнение поражения легких при COVID-19 // Туберкулез и болезни легких. — 2021. — Т. 99. — № 3. — С. 18–22. [Mikheev AV, Аftаevа EV, Kаzаkovа SS, et al. Spontaneous pneumothorax as a complication of lung injury due to COVID-19. Tuberculosis and Lung Diseases. 2021;99(3):18–22. (In Russ.)] doi: http://doi.org/10.21292/2075-1230-2021-99-3-18-22Гаман С.А., Терновой С.К., Погосова Н.В., и др. Отсроченная КТ легких у пациентов, перенесших COVID-19 пневмонию // REJR. — 2021. — Т. 11. — № 1. — С. 8–14. [Gaman SA, Ternovoy SK, Pogosova NV, et al. Delayed CT scan of the lungs in patients with COVID-19 pneumonia. REJR. 2021; 11(1):8–14. (In Russ.)] doi: https://doi.org/10.21569/2222-7415-2021-11-1-8-14Кармазановский Г.Г., Нуднов Н.В., Юдин А.Л., и др. COVID-19: лучевая диагностика и мониторинг лечения. — М.: Крафт+, 2020. — 438 с. [Karmazanovskij GG, Nudnov NV, Yudin AL., i dr. COVID-19: luchevaya diagnostika i monitoring lecheniya. M.: Kraft+; 2020. 438 s. (In Russ.)]Трофимова Т.Н., Андропова П.Л., Савинцева Ж.И., и др. Нейрорадиология в острой фазе коронавирусной инфекции — COVID-19 // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. — 2021. — Т. 13. — № 2. — С. 20–32. [Trofimova TN, Andropova PL, Savintseva ZI, et al. Radiology of the central nervous system of patients in the acute phase of СOVID-19. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders. 2021;13(2):20–32. (In Russ.)] doi: http://dx.doi.org/10.22328/2077-9828-2021-13-2-20-32Струтынская А.Д., Кошурников Д.С., Тюрин И.Е., и др. Оценка взаимосвязи рентгенологических изменений и степени тяжести заболевания у пациентов с новой коронавирусной инфекцией COVID-19 // Альманах клинической медицины. — 2021. — Т. 4. — № 2. — С. 171–178. [Strutynskaya AD, Koshurnikov DS, Tyurin IE, et al. Evaluation of an association of radiological findings and severity of the disease in patients with the new coronavirus infection (COVID-19). Almanac of Clinical Medicine. 2021;49(2):171–178. (In Russ.)] doi: https://doi.org/10.18786/2072-0505-2021-49-028