MD, PhD, Professor, Academician of the RAS
доктор медицинских наук, профессор, академик РАН
PhD in Biology
кандидат биологических наук
MD, PhD, Senior Research Associate
кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник
PhD in Chemistry
кандидат химических наук
MD, PhD, Professor
доктор медицинских наук, профессор
The pandemic of a new coronavirus infection has become a serious challenge for the health system of all countries, so as of May 2023, 766 million confirmed cases of the disease and more than 6.9 million deaths have been registered in the world. More than 22 million cases and 398 thousand deaths from a new coronavirus infection have been registered in the Russian Federation. The rapidly changing epidemiological situation necessitated the systematization of the material for analytical work. The need to create special tools for aggregating an array of heterogeneous information has become obvious. The high rate of accumulation of mutations in the genome of the pathogen made it necessary to study circulating genovariants both from the standpoint of their escape from postmorbid and postvaccinal immunity, and from the point of view of the characteristics of the epidemic process caused by individual variants of the virus and their significance for practical health care and the organization of antiepidemic measures. The significant heterogeneity in terms of population density, geographical and economic conditions of the constituent entities of the Russian Federation necessitated the organization of work on the implementation of continuous molecular genetic monitoring of the variability of the COVID-19 pathogen. The active development of computing technologies and the challenges faced by the epidemiological surveillance system during the COVID-19 pandemic created the prerequisites for the rapid development of the process of digital transformation in epidemiology. Three platforms were created on the basis of Central Research Institute of Epidemiology — the Russian data aggregation system VGARus, SOLAR and an analytical platform for analyzing the epidemiological situation regarding the new coronavirus infection based on the Superset program, which were the main tools for epidemiological monitoring of the new coronavirus infection.
Пандемия новой коронавирусной инфекции явилась серьезным вызовом для системы здравоохранения всех стран. Так, по состоянию на май 2023 г. в мире зарегистрировано 766 млн подтвержденных случаев заболевания и более 6,9 млн случаев смерти. В Российской Федерации зарегистрировано более 22 млн случаев заболевания и 398 тыс. летальных случаев от новой коронавирусной инфекции. Быстро меняющаяся эпидемиологическая ситуация обусловила потребность в систематизации материала для проведения аналитической работы. Стала очевидной необходимость создания специальных инструментов для агрегации массива разнородной информации. Высокая скорость накопления мутаций в геноме возбудителя сделала необходимым изучение циркулирующих геновариантов как с позиции ускользания их от постморбидного и поствакцинального иммунитета, так и с точки зрения особенностей эпидемического процесса, вызванного отдельными вариантами вируса, и их значимости для практического здравоохранения и организации противоэпидемических мероприятий. Значительная разнородность субъектов Российской Федерации по плотности населения, географическим и экономическим условиям обусловила необходимость организации работы по осуществлению постоянного молекулярно-генетического мониторинга изменчивости возбудителя COVID-19. Активное развитие вычислительных технологий и задачи, возникшие перед системой эпидемиологического надзора в период пандемии COVID-19, сформировали предпосылки к стремительному развитию процесса цифровой трансформации в эпидемиологии. На базе ЦНИИЭ были созданы три платформы — российская система агрегации данных VGARus, SOLAR и аналитическая платформа для анализа эпидемиологической обстановки по новой коронавирусной инфекции на базе программы Superset, которые явились основными инструментами эпидемиологического мониторинга новой коронавирусной инфекции.