Annals of the Russian academy of medical sciencesAnnals of the Russian academy of medical sciencesВестник Российской академии медицинских наук0869-60472414-3545"Paediatrician" Publishers LLC116310.15690/vramn1163PHTHISIOLOGY: CURRENT ISSUESАКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ ФТИЗИАТРИИResearch ArticleNew technologies for the diagnosis of drug-resistant tuberculosisНовые технологии диагностики лекарственно-устойчивого туберкулезаhttps://orcid.org/0000-0002-2494-92758372-1666ErgeshovAtadzhan E.ЭргешовАтаджан Эргешович
Russian Federation

MD, PhD, Professor

д.м.н., профессор

cniit@ctri.ruhttps://orcid.org/0000-0001-6288-75492267-8867ChernousovaLarisa N.ЧерноусоваЛариса Николаевна
Russian Federation

Doctor of Biological Sciences, Professor

д.б.н., профессор

lchernousova@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0003-2997-942X4775-1459AndreevskayaSofya N.АндреевскаяСофья Николаевна
Russian Federation

MD, PhD

к.м.н.

andsofia@mail.ruCentral Tuberculosis Research InstituteЦентральный научно-исследовательский институт туберкулеза211220197464134221607201929112019Copyright ©; 2019, "Paediatrician" Publishers LLCCopyright ©; 2019, Издательство "Педиатръ"2019"Paediatrician" Publishers LLCИздательство "Педиатръ"https://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/article/view/1163

Widespread drug-resistant tuberculosis is a global challenge that has a potential to have a negative impact on the global TB situation. Rapid TB diagnosis and early initiation of effective treatment based on the individualized chemotherapy regimens underpin efforts in prevention of further spread of tuberculosis. Microbiological methods of TB diagnosis that provide evidence of the TB process etiology and identify drug susceptibility of the pathogen play a very important role. The review covers the current and emerging methods of the microbiological TB diagnosis including conventional microbiological (microscopy of diagnostic material, cultural studies on solid media and culture fluids) and modern molecular genetic tests (DNA strips, biological microchips, multiplex PCR, GeneXpert and diagnostic systems of the new generation and point-of-care tests) and demonstrates the role of the described methods in the diagnostic TB laboratory algorithm. The example of the Microbiology Department of the Central TB Research Institute illustrates the effectiveness of modern developments in the diagnosis of drug-resistant tuberculosis and their impact on improving treatment success in the clinical departments of the CTRI. The review presents further prospects of drug-resistant TB diagnosis in relation to the new technologies such as Next Generation Sequencing. The conclusion summarizes information on the current state of microbiological diagnosis of drug-resistant tuberculosis and emphasizes the importance of developing and introducing new technologies into the diagnostic process.

Широкое распространение лекарственно-устойчивого туберкулеза является общемировой проблемой и способно негативно повлиять на ситуацию по туберкулезу в глобальном масштабе. Быстрая диагностика заболевания и раннее начало эффективного лечения, основанного на подборе персонализированных режимов химиотерапии, лежат в основе предотвращения распространения туберкулеза. Особое значение для диагностики туберкулеза имеют микробиологические методы, которые позволяют обосновать этиологию процесса и определить лекарственную чувствительность возбудителя. В обзоре рассматриваются актуальные и разрабатываемые методы микробиологической диагностики туберкулеза, включая классические микробиологические (микроскопия диагностического материала; культуральные исследования на плотных и жидких питательных средах) и современные молекулярно-генетические (ДНК-стрипы; биологические микрочипы; мультиплексная ПЦР; GeneXpert и другие тесты. Оценивается место описанных методов в диагностическом алгоритме лабораторий фтизиатрического профиля. На примере работы отдела микробиологии Центрального научно-исследовательского института туберкулеза (ЦНИИТ) иллюстрируется эффективность применения современных разработок в диагностике лекарственно-устойчивого туберкулеза и их влияние на улучшение терапии в клинических отделениях. Рассматриваются дальнейшие перспективы диагностики лекарственно-устойчивого туберкулеза, связанные с внедрением новейших технологий. В заключение обобщена информация о современном состоянии микробиологической диагностики лекарственно-устойчивого туберкулеза, подчеркивается важность разработки и внедрения в диагностический процесс новейших технологий.

Mycobacterium tuberculosisdrug resistancediagnosis by culturemolecular genetic methodsPCRsequencingмикобактерии туберкулезалекарственная устойчивостькультуральная диагностикамолекулярно-генетические методыПЦРсеквенированиеThis work was financially supported by the Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation within the framework of the Federal Target Program “Research and Development in Priority Directions for the Development of the Russian Science and Technology Complex for 2014–2020”, agreement No. 05.586.21.0065 (Unique identifier of the agreement RFMEFI58619X0065).Работа выполнена при финансовой поддержке Министерства науки и высшего образования Российской Федерации в рамках Федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014−2020 годы», соглашение № 05.586.21.0065 (Уникальный идентификатор соглашения RFMEFI58619X0065).Нечаева О.Б. Эпидемическая ситуация по туберкулезу в России // Туберкулез и болезни легких. ― 2018. ― Т.96. ― №8. ― С. 15−24. [Nechaeva OB. TB situation in Russia. Tuberculosis and Lung Diseases. 2018;96(8):15−24. (In Russ).] doi: 10.21292/2075-1230-2018-96-8-15-24.World Health Organization. WHO/CDS/TB/2018.20 Global tuberculosis report 2018. Geneva: WHO; 2018.Эргешов А.Э. Туберкулез в Российской Федерации: ситуация, проблемы и перспективы // Вестник РАМН. ― 2018. ― T.73. ― №5. ― С. 330−337. [Ergeshov AЕ. Tuberculosis in the Russian Federation: situation, challenges and perspectives. Annals of the Russian Academy of Medical Sciences. 2018;73(5):330−337. (In Russ).] doi: 10.15690/vramn1023.Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации № 109 от 21 марта 2003 «О совершенствовании противотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации». [Order of the Ministry of Health of the Russian Federation № 109 ″O sovershenstvovanii protivotuberkuleznykh meropriyatii v Rossiyskoi Federatsii″, dated 21 March 2003. (In Russ).] Доступно по: https://base.garant.ru/4179360/. Ссылка активна на 15.08.2019.Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации № 951 от 29 декабря 2014 «Об утверждении методических рекомендаций по совершенствованию диагностики и лечения туберкулеза органов дыхания». [Order of the Ministry of Health of the Russian Federation ″Ob utverzhdenii metodicheskikh rekomendatsii po sovershenstvovaniiu diagnostiki i lecheniia tuberkuleza organov dykhaniia», dated 9 December 2014. (In Russ).] Доступно по: https://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/70749840/. Ссылка активна на 15.08.2019.Черноусова Л.Н., Севастьянова Э.В., Ларионова Е.Е., и др. Федеральные клинические рекомендации по организации и проведению микробиологической и молекулярно-генетической диагностики туберкулеза. ― М., 2014. ― 29 с. [Chernousova LN, Sevast’yanova EV, Larionova EE, et al. Federal’nyye klinicheskiye rekomendatsii po organizatsii i provedeniiu mikrobiologicheskoi i molekuliarno-geneticheskoi diagnostiki tuberkuleza. Moscow; 2014. 29 р. (In Russ).]Tapley A, Switz N, Reber C, et al. Mobile digital fluorescence microscopy for diagnosis of tuberculosis. J Clin Microbiol. 2013;51(6):1774−1778. doi: 10.1128/JCM.03432-12.Lewis JJ, Chihota VN, van der Meulen M, et al. “Proof-of-concept” evaluation of an automated sputum smear microscopy system for tuberculosis diagnosis. PLoS One. 2012;7(11):e50173. doi: 10.1371/journal.pone.0050173.Ismail NA, Omar SV, Lewis JJ, et al. Performance of a novel algorithm using automated digital microscopy for diagnosing tuberculosis. Am J Respir Crit Care Med. 2015;191(12):1443–1449. doi: 10.1164/rccm.201502-0390OC.Jha S, Ismail N, Clark D, et al. Cost-effectiveness of automated digital microscopy for diagnosis of active tuberculosis. PLoS One. 2016;11(6):e0157554. doi: 10.1371/journal.pone.0157554.Pai M, Schito M. Tuberculosis diagnostics in 2015: landscape, priorities, needs, and prospects. J Infect Dis. 2015;211(S2):S21−28. doi: 10.1093/infdis/jiu803.Werngren J, Lisbeth K, Hoffner SE. Evaluation of a novel kit for use with the BacT/ALERT 3D system for drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis. J Clin Microbiol. 2006;44(6):2130–2132. doi: 10.1128/JCM.02218-05.Cruciani M, Scarparo C, Malena M, et al. Meta-analysis of BACTEC MGIT 960 and BACTEC 460 TB, with or without solid media, for detection of mycobacteria. J Clin Microbiol. 2004;42(5):2321−2325. doi: 10.1128/jcm.42.5.2321-2325.2004.Ciftci IH, Karakece E. Comparative evaluation of TK SLC-L, a rapid liquid mycobacterial culture medium, with the MGIT system. BMC Infect Dis. 2014;14:130. doi: 10.1186/1471-2334-14-130.World Health Organization. WHO/CDS/TB/2018.5 Technical Report on critical concentrations for drug susceptibility testing of medicines used in the treatment of drug-resistant tuberculosis. Geneva: WHO; 2018.Черноусова Л.Н., Смирнова Т.Г., Ларионова Е.Е., и др. Стандартные операционные процедуры. Определение чувствительности микобактерий туберкулеза к противотуберкулезным препаратам второго ряда с использованием системы BACTEC MGIT 960/320. ― М., 2015. ― 32 с. [Chernousova LN, Smirnova TG, Larionova EE, et al. Standartnyye operatsionnyye protsedury. Opredeleniye chuvstvitel’nosti mikobakterii tuberkuleza k protivotuberkuleznym preparatam vtorogo riada s ispol’zovaniyem sistemy BACTEC MGIT 960/320. Moscow; 2015. 32 р. (In Russ).]Дюжик Е.С., Каунетис Н.В., Смирнова Т.Г., и др. Определение критической концентрации препаратов второго ряда (циклосерина и ПАСК) для постановки теста лекарственной чувствительности в жидкой среде Middlebrook 7H9 // Туберкулез и болезни легких. ― 2016. ― Т.94. ― №1. ― С. 28−33. [Dyuzhik ES, Kaunetis NV, Smirnova TG, et al. Defining critical concentrations of the second line TB drugs (cycloserin and PAS), to establish drug susceptibility testing on the liquid medium of Middlebrook 7Н9. Tuberculosis and Lung Diseases. 2016;94(1):28−33. (In Russ).]Catanzaro A, Rodwell TC, Catanzaro DG, et al. Performance comparison of three rapid tests for the diagnosis of drug-resistant tuberculosis. PLoS One. 2015;10(8):e0136861. doi: 10.1371/journal.pone.0136861.Ramos E, Schumacher SG, Siedner M, et al. Optimizing tuberculosis testing for basic laboratories. Am J Trop Med Hyg. 2010;83(4):896−901. doi: 10.4269/ajtmh.2010.09-0566.World Health Organization and Stop TB Partnership. WHO/HTM/STB/2010.2 The global plan to stop TB 2011−2015: transforming the fight towards elimination of tuberculosis. Geneva: WHO; 2010.Смирнова Т.Г., Андреевская С.Н., Черноусова Л.Н. Молекулярно-генетическая диагностика туберкулеза и ЛУ МБТ. В кн.: Туберкулез органов дыхания. Руководство для врачей. / Под ред. проф. А.Э. Эргешова. ― М.: Галлея-Принт, 2017. ― C. 213–224. [Smirnova TG, Andreevskaya SN, Chernousova LN. Moleculyarno-geneticheskaia diagnostika tuberkuleza i LU MBT. In: Pulmonary tuberculosis. Guidelines for physicians. Ed by AE Ergeshov. Moscow: Galleya-Print; 2017. Р. 213–224. (In Russ).]World Health Organization. WHO/HTM/TB/2013.01 The use of molecular line probe assay for the detection of resistance to second-line anti-tuberculosis drugs: expert group meeting report [Internet]. Geneva: WHO; 2013 [accessed 2019 May 18]. Available from: https://apps.who.int/iris/handle/10665/78099.World Health Organization. WHO policy statement: molecular line probe assays for rapid screening of patients at risk of multidrug-resistant tuberculosis [Internet]. Geneva: WHO; 2008 [accessed 2019 May 18]. Available from: https://www.who.int/tb/laboratory/line_probe_assays/en/.Mikhailovich V, Lapa S, Gryadunov D, et al. Identification of rifampin-resistant Mycobacterium tuberculosis strains by hybridization, PCR, and ligase detection reaction on oligonucleotide microchips. J Clin Microbiol. 2001;39(7):2531−2540. doi: 10.1128/JCM.39.7.2531-2540.2001.Васильева И.А., Черноусова Л.Н., Заседателев А.С., и др. Клиническое значение микрочиповой технологии определения лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза // Проблемы туберкулеза. ― 2002. ― Т.79. ― №6. ― С. 21−24. [Vasil’yeva IA, Chernousova LN, Zasedatelev AS, et al. Klinicheskoye znacheniye mikrochipovoi tekhnologii opredeleniia lekarstvennoi ustoichivosti mikobakterii tuberkuleza. Problemy tuberkuleza. 2002;79(6):21−24. (In Russ).]Антонова О.В., Грядунов Д.А., Лапа С.А., и др. Выявление мутаций в геноме Mycobacterium tuberculosis, приводящих к устойчивости к фторхинолонам, методом гибридизации на биологических микрочипах // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. ― 2008. ― Т.145. ― №1. ― С. 115−120. [Antonova OV, Gryadunov DA, Lapa SA, et al. Detection of mutations in Mycobacterium tuberculosis genome determining resistance to fluoroquinolones by hybridization on biological microchips. Bull Exp Biol Med. 2008;145(1):108−113. (In Russ).]Вахрушева Д.В., Еремеева Н.И., Умпелева Т.В., Белоусова К.В. Опыт применения технологии «ТБ-ТЕСТ» (БИОЧИП-ИМБ, Россия) в диагностическом алгоритме // Туберкулез и болезни легких. ― 2017. ― Т.95. ― №10. ― С. 29−35. [Vakhrusheva DV, Eremeeva NI, Umpeleva TV, Belousova K.V. Experience of using TB-TEST technology (BIOCHIP-IMB, Russia) within the diagnostic procedure. Tuberculosis and Lung Diseases. 2017;95(10):29−35. (In Russ).] doi: 10.21292/2075-1230-2017-95-10-29-35.World Health Organization. WHO/HTM/TB/2013.16 Automated real-time nucleic acid amplification technology for rapid and simultaneous detection of tuberculosis and rifampicin resistance: Xpert MTB/RIF assay for the diagnosis of pulmonary and extrapulmonary TB in adults and children. Geneva: WHO; 2013.Kurbatova EV, Kaminski DA, Erokhin VV, et al. Performance of Cepheid Xpert MTB/RIF and TB-Biochip MDR in two regions of Russia with a high prevalence of drug-resistant tuberculosis. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2013;32(6):735−743. doi: 10.1007/s10096-012-1798-0.Андреевская С.Н., Смирнова Т.Г., Ларионова Е.Е., и др. Сравнение картриджной технологии Xpert MTB/RIF с микробиологическими методами выявления микобактерий туберкулеза и определения лекарственной чувствительности // Туберкулез и социально-значимые заболевания. ― 2013. ― №2. ― С. 25−29. [Andreevskaya SN, Smirnova TG, Larionova EE, et al. Comparison of Xpert MBT/RIF cartridze technology with microbiological metods for MBT detection and drug susceptibility testing. Tuberkulez I sotsial’no znachimye zabolevaniya. 2013;(2):25−29. (In Russ).]World Health Organization. WHO/HTM/TB/2017.04 WHO meeting report of a technical expert consultation: non-inferiority analysis of Xpert MTB/RIF Ultra compared to Xpert MTB/RIF [Internet]. Geneva: WHO; 2017 [accessed 2019 May 18]. Available from: https://www.who.int/tb/publications/2017/XpertUltra/en/.Андреевская С.Н., Смирнова Т.Г., Андриевская И.Ю., и др. Сравнительный анализ фенотипической и генотипической лекарственной чувствительности Mycobacterium tuberculosis, выделенных от детей и подростков из стационара ЦНИИТ за период 2011−2018 гг. // Вестник ЦНИИТ. ― 2018. ― №3. ― С. 30−41. [Andreevskaya SN, Smirnova TG, Andrievskaya IYu, et al. The comparative analysis of phenotypic and genotypic drug resistance of Mycobacterium tuberculosis isolated from children and adolescent at the hospital of the central TB research institute in 2011−2018. CTRI Bulletin. 2018;(3):30–41. (In Russ).] doi: 10.7868/S2587667818030056.Черноусова Л.Н., Ларионова Е.Е., Смирнова Т.Г., и др. Фенотипическая чувствительность к противотуберкулезным препаратам штаммов M. tuberculosis с мутациями, ассоциированными с устойчивостью к рифампицину и изониазиду // Вестник ЦНИИТ. ― 2017. ― №1. ― C. 10–18. [Chernousova LN, Larionova EE, Smirnova TG, et al. Phenotypic susceptibility to TB drugs in M. tuberculosis strains with mutations associated with rifampicinand isoniazid-resistance. CTRI Bulletin. 2017;(1):10–18. (In Russ).] doi: 10.7868/S2587667817010010.Nikam C, Kazi M, Nair C, et al. Evaluation of the Indian TrueNAT micro RT-PCR device with GeneXpert for case detection of pulmonary tuberculosis. Int J Mycobacteriol. 2014;3(3):205−210. doi: 10.1016/j.ijmyco.2014.04.003.Castan P, de Pablo A, Fernández-Romero N, et al. Point-of-care system for detection of Mycobacterium tuberculosis and rifampin resistance in sputum samples. J Clin Microbiol. 2014;52(2):502−507. doi: 10.1128/JCM.02209-13.Cabibbe AM, Miotto P, Moure R, et al. A lab-on-chip based platform for fast molecular diagnosis of multi-drug resistant tuberculosis. J Clin Microbiol. 2015;53(12):3876−3880. doi: 10.1128/JCM.01824-15.Lazzeri E, Santoro F, Oggioni MR, et al. Novel primer-probe sets for detection and identification of mycobacteria by PCR-microarray assay. J Clin Microbiol. 2012;50(11):3777−3779. doi: 10.1128/JCM.02300-12.Патент РФ на изобретение RU № 2574917. Варламов Д.А., Сочивко Д.Г., Аляпкина Ю.С., и др. Реагент, позволяющий инактивировать микроорганизмы, экстрагировать и сохранять ДНК бактерий в форме, пригодной для высокоэффективной молекулярной диагностики. [Patent RUS № 2574917. Varlamov DA, Sochivko DG, Alyapkina YuS, et al. Reagent, pozvoliaiushchii inaktivirovat’ mikroorganizmy, ekstragirovat’ i sokhraniat’ DNK bakterii v forme, prigodnoi dlia vysokoeffektivnoi molekuliarnoi diagnostiki. (In Russ).] Доступно по: http://www.freepatent.ru/patents/2574917. Ссылка активна на 18.05.2019.Hofmann-Thiel S, Molodtsov N, Antonenka U, Hoffmann H. Evaluation of the Abbott RealTime MTB and RealTime MTB INH/RIF assays for direct detection of Mycobacterium tuberculosis complex and resistance markers in respiratory and extrapulmonary specimens. J Clin Microbiol. 2016;54(12):3022−3027. doi: 10.1128/JCM.01144-16.Park KS, Kim JY, Lee JW, et al. Comparison of the Xpert MTB/RIF and Cobas TaqMan MTB assays for detection of Mycobacterium tuberculosis in respiratory specimens. J Clin Microbiol. 2013;51(10):3225−3227. doi: 10.1128/JCM.01335-13.Zimmermann S, Dalpke A, Murray P, et al. Pre-validation of the BD Max MDR-TB assay for the rapid detection of MTBc DNA and mutations associated with rifampin and isoniazid resistance [Abstract]. 28th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID); 2018 Apr 21−24; Madrid, Spain; 2018 [accessed 2019 May 18]. Available from: https://www.escmid.org/escmid_publications/escmid_elibrary/material/?mid=61376.Holmberg RC, Gindlesperger A, Stokes T, et al. Akonni TruTip and Qiagen methods for extraction of fetal circulating DNA ― evaluation by real-time and digital PCR. PLoS One. 2013;8(8):e73068. doi: 10.1371/journal.pone.0073068.Chernousova LN, Smirnova TG, Varlamov DA, et al. Automation of multi-drug resistant tuberculosis PCR diagnostics. Int J Tuberc Lung Dis. 2013;17(12 Suppl 2):S400.Bertelli C, Greub G. Rapid bacterial genome sequencing: methods and applications in clinical microbiology. Clin Microbiol Infect. 2013;19(9):803−813. doi: 10.1111/1469-0691.12217.Sanger F, Nicklen S, Coulson AR. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors. Proc Natl Acad Sci U S A. 1977;74(12):5463−5467. doi: 10.1073/pnas.74.12.5463.Ashton PM, Nair S, Dallman T, et al. MinION nanopore sequencing identifies the position and structure of a bacterial antibiotic resistance island. Nat Biotechnol. 2015;33(3):296−300. doi: 10.1038/nbt.3103.Sims D, Sudbery I, Ilott NE, et al. Sequencing depth and coverage: key considerations in genomic analyses. Nat Rev Genet. 2014;15(2):121−132. doi: 10.1038/nrg3642.Flandrois JP, Lina G, Dumitrescu O. MUBII-TB-DB: a database of mutations associated with antibiotic resistance in Mycobacterium tuberculosis. BMC Bioinformatics. 2014;15:107. doi: 10.1186/1471-2105-15-107.Gardy JL. Towards genomic prediction of drug resistance in tuberculosis. Lancet Infect Dis. 2015;15(10):1124−1125. doi: 10.1016/S1473-3099(15)00088-2.Sandgren A, Strong M, Muthukrishnan P, et al. Tuberculosis drug resistance mutation database. PLoS Med. 2009;6(2):e2. doi: 10.1371/journal.pmed.1000002.Prasanna A, Niranjan V. Classification of Mycobacterium tuberculosis DR, MDR, XDR isolates and identification of signature mutation pattern of drug resistance. Bioinformation. 2019;15(4):261−268. doi: 10.6026/97320630015261.Coll F, McNerney R, Preston MD, et al. Rapid determination of anti-tuberculosis drug resistance from whole-genome sequences. Genome Med. 2015;7(1):51. doi: 10.1186/s13073-015-0164-0.Bradley P, Gordon NC, Walker TM, et al. Rapid antibiotic-resistance predictions from genome sequence data for Staphylococcus aureus and Mycobacterium tuberculosis. Nat Commun. 2015;6:10063. doi: 10.1038/ncomms10063.Pankhurst LJ, Del Ojo Elias C, Votintseva AA, et al. Rapid, comprehensive, and affordable mycobacterial diagnosis with whole-genome sequencing: a prospective study. Lancet Respir Med. 2016;4(1):49−58. doi: 10.1016/S2213-2600(15)00466-X.Dippenaar A, Warren RM. Fighting an old disease with next-generation sequencing. Elife. 2015;4:e06782. doi: 10.7554/eLife.06782.Lyon E, Cockerill FR, Bale SJ, et al. Next-generation sequencing in clinical diagnostics: experiences of early adopters. Clin Chem. 2015;61(1):41−49. doi: 10.1373/clinchem.2014.222687.Walker TM, Kohl TA, Omar SV, et al. Whole-genome sequencing for prediction of Mycobacterium tuberculosis drug susceptibility and resistance: a retrospective cohort study. Lancet Infect Dis. 2015;15(10):1193–1202. doi: 10.1016/S1473-3099(15)00062-6.Schito M, Dolinger DL. A collaborative approach for “ReSeq-ing” Mycobacterium tuberculosis drug resistance: convergence for drug and diagnostic developers. EBioMedicine. 2015;2(10):1262–1265. doi: 10.1016/j.ebiom.2015.10.008.ВОЗ. Европейское региональное бюро. Aлгоритм лабораторной диагностики и мониторинга лечения туберкулеза легких и туберкулеза с лекарственной устойчивостью на основе применения современных быстрых молекулярных методов [интернет]. WHO: Regional Office for Europe; 2017. [WHO. Regional Office for Europe. Algorithm for laboratory diagnosis and treatment-monitoring of pulmonary tuberculosis and drug-resistant tuberculosis using state-of-the-art rapid molecular diagnostic technologies [Internet]. WHO: Regional Office for Europe; 2017. (In Russ).] Доступно по: http://www.euro.who.int/__data/assets/pdf_file/0004/336118/ELI-TB-Laboratory_diag_algorithm_RUS.pdf?ua=1. Ссылка активна на 18.05.2019.Севастьянова Э.В., Ларионова Е.Е., Смирнова Т.Г., и др. Оценка результатов выявления микобактерий, полученных различными методами исследования // Медицинский альянс. ― 2018. ― №3. ― С. 25−30. [Sevastyanova EV, Larionova EE, Smirnova TG, et al. Evaluation of the results of Mycobacterium detection, obtained by different studies methods. Medical alliance. 2018;(3):25−30. (In Russ).]Васильева И.А., Аксенова В.А., Эргешов А.Э., и др. Федеральные клинические рекомендации по диагностике и лечению туберкулеза органов дыхания. ― М.: Триада, 2014. ― 55 с. [Vasil’yeva IA, Aksenova VA, Ergeshov AE, et al. Federal’nyye klinicheskiye rekomendatsii po diagnostike i lecheniiu tuberkuleza organov dykhaniia. Moscow: Triada; 2014. 55 р. (In Russ).]Васильева И.А., Аксенова В.А., Эргешов А.Э., и др. Федеральные клинические рекомендации по диагностике и лечению туберкулеза органов дыхания множественной и широкой лекарственной устойчивостью возбудителя. ― М.: Триада, 2014. ― 71 с. [Vasil’yeva IA, Aksenova VA, Ergeshov AE, et al. Federal’nyye klinicheskiye rekomendatsii po diagnostike i lecheniiu tuberkuleza organov dykhaniia mnozhestvennoi i shirokoi lekarstvennoi ustoichivost’i u vozbuditelia. Moscow: Triada; 2014. 71 р. (In Russ).]Ergeshov A, Andreevskaya S, Smirnova T, et al. The dynamics of M. tuberculosis drug resistance isolated from pulmonary TB patients at the Central TB Research Institute, Moscow, 2012−2017. Int J Tuberc Lung Dis. 2018;2(11 Suppl. 2):S208.